La hormona antimülleriana (AMH) se propone como un biomarcador de fertilidad en el ganado, sin embargo, esta relación asociativa parece estar influenciada por el estrés por calor (HS). El objetivo fue probar la AMH sérica y los polimorfismos de nucleótido único (SNP) relacionados con la AMH como marcadores potencialmente predictivos de rasgos reproductivos en vacas lecheras que experimentan HS. El estudio incluyó 300 vacas Holstein que fueron genotipadas utilizando BovineSNP50 (54,000 SNP). Luego se llevó a cabo un estudio de asociación del genoma completo. Se encontraron nueve SNP intragénicos dentro de las vías que influyen en el gen como importantes con pruebas de ajuste por comparaciones múltiples (< 1.09 x 10). Se realizó un estudio de validación adicional en una población independiente de ganado Holstein, que se dividió en grupos de estrés por calor moderado (MH; = 152) y severo (SH; = 128) y luego se sometió a un programa de manejo reproductivo de verano. Se confirmó que la AMH sérica es un predictor de medidas de fertilidad (< 0.05) en MH pero no en el grupo SH. Las vacas fueron genotipadas, lo que reveló cuatro SNP como marcadores predictivos para la AMH sérica (< 0.01), rasgos reproductivos (< 0.01) y variables fisiológicas adicionales (< 0.05). Estos SNP estaban en los genes , , , y . En conclusión, se proponen las concentraciones de AMH sérica y los polimorfismos de AMH como marcadores predictivos que pueden utilizarse junto con enfoques de valor de cría genómica para mejorar el rendimiento reproductivo en vacas Holstein expuestas a condiciones de HS en verano.