La colitis ulcerosa (CU) se caracteriza por la inflamación crónica del intestino grueso, remisiones repetidas y recaídas de síntomas. Aunque componentes desconocidos en las regiones colónicas están profundamente involucrados en la patogénesis de la CU, las causas del desarrollo y agravamiento de la CU aún no se han elucidado en detalle. Para identificar factores clave, investigamos los cambios en los componentes proteicos en el intestino grueso de ratas con colitis experimental inducida por sulfato de dextrano sódico (CUC). Los componentes que diferían en su concentración entre ratas normales (WT) y CUC fueron cuidadosamente investigados mediante separación electroforética y espectrometría de masas. Basado en estos resultados, se observaron siete proteínas con diferentes niveles de expresión entre WT y CUC. Entre ellas, nos centramos en la anhidrasa carbónica III (CA-III) en la patogénesis de la CU. Las concentraciones de CA-III en el tejido colónico y suero se midieron cuantitativamente utilizando un ensayo de inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA) y PCR en tiempo real, y los niveles disminuyeron significativamente tanto en el tejido colónico como en el suero de CUC con el agravamiento de la CU experimental. En un ensayo, se investigó la función de CA-III en macrófagos peritoneales (M) de ratas. Al estimular M con lipopolisacárido (LPS), la concentración de CA-III disminuyó significativamente en el citoplasma de estas células. Los M tratados con un anticuerpo anti-CAIII seguido de estimulación con LPS secretaron activamente citoquinas inflamatorias, particularmente interleucina-6 y factor de necrosis tumoral-alfa. Por lo tanto, CA-III en M parece ser un regulador inmune que suprime la secreción de citoquinas inflamatorias.