El creciente interés en los reptiles ha planteado un desafío para los clínicos veterinarios debido a la falta de un sistema estandarizado para realizar estudios anatómicos similares a los utilizados para perros y gatos. En este artículo, hemos intentado describir, empleando tomografía computarizada y reconstrucciones tridimensionales posteriores, las características anatómicas normales que comprenden los cráneos de dos especies de reptiles: la tortuga boba y la iguana verde. La tomografía computarizada (TC) y el procesamiento de imágenes posterior permitieron la identificación de las estructuras óseas que componen la cabeza de estas especies. Como resultado, y basándonos en artículos anteriores, proponemos las diferencias y similitudes anatómicas más significativas entre estas especies.