En la búsqueda de una mayor producción de arroz, a menudo hemos puesto en peligro el suelo a un ritmo alarmante. Se postula que las prácticas agrícolas intensivas degradan la salud del suelo y aumentan la abundancia de enfermedades del arroz, mientras que el barbecho aumenta la abundancia de agentes de control biológico. En este estudio, se monitoreó la comunidad bacteriana en el suelo del arrozal y en barbecho. Proteobacteria, Bacteroidetes y Actinobacteria eran abundantes en el suelo en barbecho, mientras que Acidobacteria, Chloroflexi y Gemmatimonadetes eran más abundantes en el suelo del arrozal. Entre los posibles agentes de control biológico, , , , , , , y eran más abundantes en el suelo en barbecho, mientras que y eran más abundantes en el suelo del arrozal. Los posibles patógenos del arroz, es decir, y , eran más abundantes en el suelo del arrozal. La diversidad alfa era mayor en el suelo del arrozal que en el suelo en barbecho. Además, el análisis de coordenadas principales basado en las distancias de UniFrac reveló grupos distintos de los suelos. Además, el análisis funcional sugirió que el suelo en barbecho era abundante en genes asociados con la biosíntesis de sideróforos y metabolitos secundarios. En contraste, el suelo del arrozal era abundante en genes relacionados con las interacciones planta-patógeno. En conclusión, estos resultados destacan la importancia del barbecho para mejorar la salud del suelo.