Probando la convergencia de diferentes métodos de energía libre en un sistema analítico simple con barreras ocultas
Autores: Paz, S. Alexis; Abrams, Cameron F.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2018
Acceso abierto
Artículo científico
2018
Probando la convergencia de diferentes métodos de energía libre en un sistema analítico simple con barreras ocultas
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Ingeniería de Sistemas
Palabras clave
Influencia
Barreras ocultas
Comportamiento de convergencia
Métodos de cálculo de energía libre
Metadinámica
Fuerzas de sesgo adaptativas
Parametrización sobre la marcha
Superficies de energía potencial
Desafíos de muestreo
Métodos de muestreo adaptativos
Requisito de alta fricción
Variables colectivas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
En este trabajo, estudiamos la influencia de las barreras ocultas en el comportamiento de convergencia de tres métodos de cálculo de energía libre: metadinámica bien templada (WTMD), fuerzas de sesgo adaptativas (ABF) y parametrización sobre la marcha (OTFP). Construimos superficies de potencial de energía (PES) bidimensionales simples que permiten un resultado analítico exacto para la energía libre en cualquier parámetro de orden unidimensional. Luego elegimos diferentes definiciones de CV y parámetros de PES para crear tres sistemas diferentes con desafíos de muestreo crecientes. Descubrimos que los tres métodos no se ven muy afectados por las barreras ocultas en el caso más simple considerado. Los métodos de muestreo adaptativo muestran un muestreo más rápido, mientras que el requisito auxiliar de alta fricción de OTFP lo hace más lento para este caso. Sin embargo, un ligero cambio en la definición de CV tiene un fuerte impacto en el rendimiento de ABF y WTMD, lo que ilustra la importancia de elegir variables colectivas adecuadas.
Descripción
En este trabajo, estudiamos la influencia de las barreras ocultas en el comportamiento de convergencia de tres métodos de cálculo de energía libre: metadinámica bien templada (WTMD), fuerzas de sesgo adaptativas (ABF) y parametrización sobre la marcha (OTFP). Construimos superficies de potencial de energía (PES) bidimensionales simples que permiten un resultado analítico exacto para la energía libre en cualquier parámetro de orden unidimensional. Luego elegimos diferentes definiciones de CV y parámetros de PES para crear tres sistemas diferentes con desafíos de muestreo crecientes. Descubrimos que los tres métodos no se ven muy afectados por las barreras ocultas en el caso más simple considerado. Los métodos de muestreo adaptativo muestran un muestreo más rápido, mientras que el requisito auxiliar de alta fricción de OTFP lo hace más lento para este caso. Sin embargo, un ligero cambio en la definición de CV tiene un fuerte impacto en el rendimiento de ABF y WTMD, lo que ilustra la importancia de elegir variables colectivas adecuadas.