La tripanosomiasis animal africana (AAT) es una enfermedad tropical desatendida que se propaga a través del vector de la mosca tse-tse, que transporta el parásito en su saliva. En particular, esta enfermedad parasitaria afecta la salud del ganado, imponiendo así restricciones económicas a los agricultores, costando miles de millones de dólares cada año, especialmente en los países de África subsahariana. Considerando principalmente la enfermedad AAT como un proceso de progresión multietapa, previamente realizamos un análisis ascendente para identificar factores de transcripción (TFs), sus cooperaciones, vías sobre-representadas y reguladores maestros. Sin embargo, el análisis descendente, que incluye efectores, perfiles de expresión génica correspondientes y su asociación con los SNPs regulatorios (rSNPs), aún no se ha establecido. Por lo tanto, en este estudio, nuestro objetivo es investigar la compleja interacción de los rSNPs, la expresión génica correspondiente y los efectores descendentes con respecto a la progresión de la enfermedad AAT basada en dos razas de ganado: Boran, susceptible a tripanosomas, y N"Dama, tolerante a tripanosomas. Nuestros hallazgos proporcionan información mecanicista sobre los efectores involucrados en la regulación de varias vías de transducción de señales, diferenciando así el mecanismo molecular con respecto a las respuestas inmunitarias de las razas de ganado. Los efectores y sus genes asociados (especialmente, , , , y ) podrían ser candidatos prometedores para fármacos, ya que orquestan diversas cascadas regulatorias descendentes en ambas razas de ganado.