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Analizando conjuntos de datos biomédicos con la teoría de resonancia adaptativa de árbol simbólico

Autores: Petrenko, Sasha; Hier, Daniel B.; Bone, Mary A.; Obafemi-Ajayi, Tayo; Timpson, Erik J.; Marsh, William E.; Speight, Michael; Wunsch, Donald C.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Analizando conjuntos de datos biomédicos con la teoría de resonancia adaptativa de árbol simbólico


Categoría

Gestión y administración

Subcategoría

Gestión de la tecnología y la inovación

Palabras clave

Conjuntos de datos biomédicos
Enfermedades humanas
Genes
Fenotipos
Mutaciones genéticas
Estructuras de proteínas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 1

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los conjuntos de datos biomédicos destilan muchos mecanismos de enfermedades humanas, vinculando enfermedades a genes y fenotipos (signos y síntomas de la enfermedad), mutaciones genéticas a estructuras proteicas alteradas, y proteínas alteradas a cambios en funciones moleculares y procesos biológicos. Es deseable obtener nuevos conocimientos a partir de estos datos, especialmente en lo que respecta al descubrimiento de estructuras jerárquicas relacionadas con variantes de enfermedades. Sin embargo, el análisis con este fin ha demostrado ser difícil debido a la complejidad de las conexiones entre datos simbólicos multicategóricos. Este artículo propone la teoría de resonancia adaptativa de árboles simbólicos (START), con formulaciones adicionales de vigilancia dual supervisada (DV-START) y vigilancia dual distribuida (DDV-START), para el agrupamiento de datos simbólicos multicategóricos de conjuntos de datos biomédicos, demostrando su utilidad en el agrupamiento de variantes de la enfermedad de Charcot-Marie-Tooth utilizando datos genómicos, fenotípicos y proteómicos.

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