Evaluando múltiples combinaciones alélicas para determinar la variación del ángulo de macollamiento en arroz
Autores: Jang, Su; Kang, Yoo Seok; Lee, Yoon Kyung; Koh, Hee-Jong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Evaluando múltiples combinaciones alélicas para determinar la variación del ángulo de macollamiento en arroz
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
ángulo del timón
Arquitectura de la planta de arroz
Marcadores SNP
Modelo de regresión lineal
Programas de mejoramiento
Variables independientes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 30
Citaciones: Sin citaciones
El ángulo de inclinación de la macolla es un factor influyente importante en la arquitectura de la planta de arroz que afecta la densidad de siembra y el rendimiento por unidad de área. Las herramientas moleculares para predecir el ángulo de la macolla contribuyen a los programas de mejoramiento genético, que tienen como objetivo optimizar la arquitectura de la planta de arroz. En este estudio, se desarrollaron varios marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) relacionados con el ángulo de la macolla y se utilizaron con una población modelo para definir un modelo de regresión lineal para la predicción del ángulo de la macolla en el arroz. El modelo de regresión lineal resultante, que consta de ocho marcadores SNP como variables independientes, se evaluó utilizando una población de prueba independiente. En general, el modelo de regresión logró un ajustado de 0,51 y mostró una precisión predictiva consistente con un de 0,61. Tres de las ocho variables independientes, a saber, PIN2-1, LIC1-1 y TAC1, contribuyeron sustancialmente al modelo de regresión lineal. Estos tres marcadores de efecto mayor también fueron determinantes importantes del ángulo de la macolla en la población de prueba independiente. Las combinaciones alélicas de los tres marcadores de efecto mayor modularon el ángulo de la macolla en un rango de 5,6 a 19 grados. Los marcadores de ADN y el modelo de regresión lineal desarrollados en este estudio facilitarán los programas de mejoramiento de arroz para mejorar la arquitectura de la planta.
Descripción
El ángulo de inclinación de la macolla es un factor influyente importante en la arquitectura de la planta de arroz que afecta la densidad de siembra y el rendimiento por unidad de área. Las herramientas moleculares para predecir el ángulo de la macolla contribuyen a los programas de mejoramiento genético, que tienen como objetivo optimizar la arquitectura de la planta de arroz. En este estudio, se desarrollaron varios marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) relacionados con el ángulo de la macolla y se utilizaron con una población modelo para definir un modelo de regresión lineal para la predicción del ángulo de la macolla en el arroz. El modelo de regresión lineal resultante, que consta de ocho marcadores SNP como variables independientes, se evaluó utilizando una población de prueba independiente. En general, el modelo de regresión logró un ajustado de 0,51 y mostró una precisión predictiva consistente con un de 0,61. Tres de las ocho variables independientes, a saber, PIN2-1, LIC1-1 y TAC1, contribuyeron sustancialmente al modelo de regresión lineal. Estos tres marcadores de efecto mayor también fueron determinantes importantes del ángulo de la macolla en la población de prueba independiente. Las combinaciones alélicas de los tres marcadores de efecto mayor modularon el ángulo de la macolla en un rango de 5,6 a 19 grados. Los marcadores de ADN y el modelo de regresión lineal desarrollados en este estudio facilitarán los programas de mejoramiento de arroz para mejorar la arquitectura de la planta.