El esturión chino es una especie en peligro crítico de extinción con un valor ecológico y cultural significativo. Comprender los mecanismos moleculares que subyacen a su crecimiento es crucial para mejorar la eficiencia de la cría y potenciar los esfuerzos de conservación. En este estudio, realizamos un análisis comparativo del transcriptoma de tejidos musculares de individuos de esturión chino de rápido y lento crecimiento. Identificamos 258 genes expresados diferencialmente (DEGs), con 144 regulados al alza y 114 regulados a la baja en el grupo de rápido crecimiento en comparación con el grupo de lento crecimiento. El análisis de enriquecimiento de la ontología genética (GO) reveló que estos DEGs estaban principalmente involucrados en procesos metabólicos, procesos celulares y regulación biológica. El análisis de rutas de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) mostró un enriquecimiento significativo en rutas como la vía de señalización de insulina, la vía de señalización de adipocinas y el metabolismo de glicerolípidos. La regulación al alza de genes relacionados con procesos metabólicos y producción de energía en el grupo de rápido crecimiento sugiere una tasa metabólica más alta que contribuye a un crecimiento más rápido. Por el contrario, los genes regulados a la baja asociados con la respuesta inmune y la proteólisis pueden indicar un compromiso entre el crecimiento y la función inmune. Estos hallazgos proporcionan valiosos conocimientos sobre la base genética de las diferencias de crecimiento en el esturión chino y destacan posibles objetivos para la cría selectiva y estrategias de conservación.