Análisis basado en transcriptomas del mecanismo de acción de los trastornos metabólicos inducidos por el estrés por cobre en el agua en
Autores: Huang, Dongyu; Zhang, Lu; Mi, Haifeng; Teng, Tao; Liang, Hualiang; Ren, Mingchun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis basado en transcriptomas del mecanismo de acción de los trastornos metabólicos inducidos por el estrés por cobre en el agua en
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Efectos
Cambios en la expresión génica
Vías moleculares
Funciones fisiológicas
Estrés por cobre en el agua
Análisis de secuenciación de transcritos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
Para revelar los efectos del estrés por cobre en el agua sobre los cambios en la expresión génica, las vías moleculares y las funciones fisiológicas, los peces juveniles se dividieron equitativamente en dos grupos experimentales, y los niveles de cobre fueron de 1.61 +/- 0.03 mg/L (grupo expuesto al cobre) y 0 mg/L (grupo de control), respectivamente. Después de 4 horas, se recolectaron muestras de tejido branquial para análisis de secuenciación de transcriptos, y se construyeron dos bibliotecas del grupo de tratamiento con cobre (Cu) y del grupo de control (C) y se secuenciaron utilizando tecnología de secuenciación Illumina. Los resultados mostraron que se obtuvieron aproximadamente 40.2-46.0 M de lecturas limpias de cada biblioteca, y el porcentaje de transcriptos mapeados de manera única osciló entre 80.57 y 84.93%. Se identificaron un total de 3915 genes expresados diferencialmente (DEGs) bajo estrés por cobre en el agua, de los cuales 1300 genes fueron regulados al alza y 2615 genes fueron regulados a la baja. Se seleccionaron al azar doce DEGs para análisis de RT-PCR cuantitativa (qRT-PCR), y los resultados confirmaron que el análisis del transcriptoma era confiable. Además, los DEGs fueron sometidos a análisis de enriquecimiento de la Ontología Génica (GO) y de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG), y los resultados mostraron que la mayoría de los DEGs estaban involucrados en vías metabólicas, incluyendo la biosíntesis de esteroides, el metabolismo del glutatión y las vías de señalización del receptor activado por proliferadores de peroxisomas (PPAR). Además, debido a los niveles de cobre en el agua, se reguló significativamente al alza, mientras que otros genes relacionados con el metabolismo fueron regulados significativamente a la baja. Además, el grupo expuesto al cobre redujo significativamente la expresión de algunos genes de inmunidad y aumentó la expresión de. En resumen, estos resultados indicaron que el cobre causa trastornos metabólicos y un suministro de energía insuficiente en el organismo, e induce estrés oxidativo, lo que resulta en funciones inmunitarias reducidas.
Descripción
Para revelar los efectos del estrés por cobre en el agua sobre los cambios en la expresión génica, las vías moleculares y las funciones fisiológicas, los peces juveniles se dividieron equitativamente en dos grupos experimentales, y los niveles de cobre fueron de 1.61 +/- 0.03 mg/L (grupo expuesto al cobre) y 0 mg/L (grupo de control), respectivamente. Después de 4 horas, se recolectaron muestras de tejido branquial para análisis de secuenciación de transcriptos, y se construyeron dos bibliotecas del grupo de tratamiento con cobre (Cu) y del grupo de control (C) y se secuenciaron utilizando tecnología de secuenciación Illumina. Los resultados mostraron que se obtuvieron aproximadamente 40.2-46.0 M de lecturas limpias de cada biblioteca, y el porcentaje de transcriptos mapeados de manera única osciló entre 80.57 y 84.93%. Se identificaron un total de 3915 genes expresados diferencialmente (DEGs) bajo estrés por cobre en el agua, de los cuales 1300 genes fueron regulados al alza y 2615 genes fueron regulados a la baja. Se seleccionaron al azar doce DEGs para análisis de RT-PCR cuantitativa (qRT-PCR), y los resultados confirmaron que el análisis del transcriptoma era confiable. Además, los DEGs fueron sometidos a análisis de enriquecimiento de la Ontología Génica (GO) y de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG), y los resultados mostraron que la mayoría de los DEGs estaban involucrados en vías metabólicas, incluyendo la biosíntesis de esteroides, el metabolismo del glutatión y las vías de señalización del receptor activado por proliferadores de peroxisomas (PPAR). Además, debido a los niveles de cobre en el agua, se reguló significativamente al alza, mientras que otros genes relacionados con el metabolismo fueron regulados significativamente a la baja. Además, el grupo expuesto al cobre redujo significativamente la expresión de algunos genes de inmunidad y aumentó la expresión de. En resumen, estos resultados indicaron que el cobre causa trastornos metabólicos y un suministro de energía insuficiente en el organismo, e induce estrés oxidativo, lo que resulta en funciones inmunitarias reducidas.