El flujo de agua es un factor ambiental importante que afecta la fisiología de los peces. En este estudio, realizamos la secuenciación del transcriptoma hepático para explorar sus respuestas moleculares bajo diferentes niveles de estrés por velocidad de flujo. Los resultados revelaron que velocidades de flujo moderadas a altas afectaron significativamente procesos biológicos clave, incluyendo el metabolismo energético, la homeostasis de proteínas y el estrés del retículo endoplásmico. Notablemente, una alta velocidad de flujo de 90 cm/s pareció servir como un umbral crítico que induce estas respuestas fisiológicas. En aplicaciones prácticas, la acuicultura en aguas profundas y abiertas a menudo enfrenta desafíos como corrientes fuertes y condiciones hidrodinámicas complejas. Por lo tanto, nuestros hallazgos proporcionan nuevas perspectivas sobre los mecanismos de adaptación molecular bajo estrés por velocidad de flujo y ofrecen una referencia valiosa para la selección de sitios de sistemas de acuicultura en jaulas en aguas profundas.