La expresión visible y duradera del estro en cerdas y cerdas jóvenes envía efectivamente una señal de apareamiento. Para revelar los roles de los ARN largos no codificantes intergénicos (lincARNs) en la expresión del estro, se utilizó RNA-seq para investigar la expresión de lincARNs en tejidos foliculares de cerdas jóvenes Large White en diestro (LD) y en estro (LE), y cerdas jóvenes Mi chinas en diestro (MD) y en estro (ME). Se encontraron setenta y tres lincARNs expresados diferencialmente (DELs) en todas las comparaciones (LE vs. ME, LD vs. LE y MD vs. ME). Once lincARNs se expresaron diferencialmente en ambas comparaciones LD vs. LE y MD vs. ME. Quince DELs se mapearon en los fragmentos de loci de rasgos cuantitativos (QTL) del número de cuerpo lúteo en cerdos. Luego se construyó una red de interacción proteína-proteína (PPI) que involucró la expresión del estro utilizando 20 DEGs. Curiosamente, se observaron tres DEGs objetivo predichos (PTGs) (de MSTRG.10910, de MSTRG.10910 y MSTRG.23984, de MSTRG.1559) en la red PPI. Se construyó una red de ARN endógeno competitivo (ceRNA) que incluía tres lincARNs, cinco miARNs y cinco genes. Nuestro estudio proporciona una nueva perspectiva sobre los lincARNs asociados con la expresión del estro y el desarrollo folicular en cerdas jóvenes.