Análisis transcriptómico de branquias bajo estrés hipóxico agudo
Autores: Zhang, Huakun; Li, Run; Wang, Yaohui; Zhou, Jinxu; Xu, Hao; Gou, Meng; Ye, Jianhua; Qiu, Xuemei; Wang, Xiuli
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis transcriptómico de branquias bajo estrés hipóxico agudo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Branquias pequeñas
Baja capacidad respiratoria
Estrés hipóxico
Análisis transcriptómicos
Genes expresados diferencialmente
Estrés oxidativo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
tiene branquias y poros branquiales relativamente pequeños, lo que conduce a una capacidad respiratoria relativamente baja y una mayor vulnerabilidad a los niveles bajos de oxígeno disuelto (OD) en comparación con otros peces. Para investigar las respuestas al estrés hipóxico agudo, se realizaron análisis transcriptómicos basados en secuenciación de alto rendimiento para evaluar las respuestas de las branquias al estrés hipóxico agudo. Se compararon tres condiciones ambientales, incluyendo normoxia (OD: 7.0 +/- 0.2 mg/L), estrés hipóxico (OD: 0.9 +/- 0.2 mg/L) y reoxigenación (4, 8, 12 y 24 h después del regreso a la normoxia) para identificar genes diferencialmente expresados (GDE) sensibles a la hipoxia. Se identificaron un total de 992, 877, 1561, 1412 y 679 GDE en los grupos de normoxia y reoxigenación para 4, 8, 12 y 24 h en comparación con los grupos de hipoxia, respectivamente. Los GDE estaban principalmente asociados con el estrés oxidativo, el crecimiento y desarrollo, y las respuestas inmunitarias. Además, el análisis de enriquecimiento de anotación funcional de los GDE reveló que estaban principalmente relacionados con interacciones citoquina-citoquina, el receptor del factor de crecimiento transformante beta (TGF-beta), moléculas de adhesión celular (CAM), la vía de señalización del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) y la vía de señalización de la quinasa activada por mitógenos (MAPK). Estos resultados proporcionan nuevas perspectivas sobre los mecanismos fisiológicos y bioquímicos de las adaptaciones al estrés hipóxico. Además, estos resultados ofrecen un marco para futuros estudios sobre los mecanismos moleculares de la tolerancia a la hipoxia y la cultura saludable de otros peces.
Descripción
tiene branquias y poros branquiales relativamente pequeños, lo que conduce a una capacidad respiratoria relativamente baja y una mayor vulnerabilidad a los niveles bajos de oxígeno disuelto (OD) en comparación con otros peces. Para investigar las respuestas al estrés hipóxico agudo, se realizaron análisis transcriptómicos basados en secuenciación de alto rendimiento para evaluar las respuestas de las branquias al estrés hipóxico agudo. Se compararon tres condiciones ambientales, incluyendo normoxia (OD: 7.0 +/- 0.2 mg/L), estrés hipóxico (OD: 0.9 +/- 0.2 mg/L) y reoxigenación (4, 8, 12 y 24 h después del regreso a la normoxia) para identificar genes diferencialmente expresados (GDE) sensibles a la hipoxia. Se identificaron un total de 992, 877, 1561, 1412 y 679 GDE en los grupos de normoxia y reoxigenación para 4, 8, 12 y 24 h en comparación con los grupos de hipoxia, respectivamente. Los GDE estaban principalmente asociados con el estrés oxidativo, el crecimiento y desarrollo, y las respuestas inmunitarias. Además, el análisis de enriquecimiento de anotación funcional de los GDE reveló que estaban principalmente relacionados con interacciones citoquina-citoquina, el receptor del factor de crecimiento transformante beta (TGF-beta), moléculas de adhesión celular (CAM), la vía de señalización del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) y la vía de señalización de la quinasa activada por mitógenos (MAPK). Estos resultados proporcionan nuevas perspectivas sobre los mecanismos fisiológicos y bioquímicos de las adaptaciones al estrés hipóxico. Además, estos resultados ofrecen un marco para futuros estudios sobre los mecanismos moleculares de la tolerancia a la hipoxia y la cultura saludable de otros peces.