La densidad de folículos de plumas juega un papel importante en las primeras impresiones de los consumidores al tomar decisiones de compra. Sin embargo, la red molecular que contribuye a este rasgo sigue siendo en gran medida desconocida. El objetivo de este estudio fue realizar análisis de transcriptoma y de red de coexpresión génica ponderada para determinar los genes candidatos relacionados con la densidad de folículos de plumas en pollos machos Wannan. En total, quinientos pollos machos Wannan de un día de edad se mantuvieron en un sistema de jaulas convencional. Se registró la densidad de folículos de plumas para cada ave a las 12 semanas de edad. A las 12 semanas, se seleccionaron quince muestras de tejido cutáneo para el análisis de red de coexpresión génica ponderada, de las cuales se seleccionaron seis muestras de tejido cutáneo (tres aves en el grupo H y tres aves en el grupo L) para el análisis de transcriptoma. Los resultados mostraron que, en total, se identificaron 95 genes expresados diferencialmente (DEGs), y 56 genes estaban sobreexpresados y 39 genes estaban subexpresados en el grupo de alta densidad de folículos de plumas en comparación con el grupo de baja densidad de folículos de plumas. Se identificaron trece módulos de coexpresión génica. El módulo rojo estaba altamente correlacionado negativamente con la densidad de folículos de plumas (< 0.01), con un coeficiente de correlación negativo significativo de -0.72. En total, se seleccionaron 103 genes centrales del módulo rojo. Al comparar los 103 genes centrales con los genes expresados diferencialmente (DEGs), se observó que 13 genes eran comunes a ambos conjuntos, incluyendo , , , , y . Del módulo rojo, , , , , , y fueron seleccionados como los genes más importantes. Estos genes se enriquecieron en la vía de unión al ADN, la vía de unión a compuestos heterocíclicos, la vía del ciclo celular y la vía de meiosis de oocitos. Este estudio sugiere que , , , , , y pueden estar involucrados en la regulación del desarrollo de la densidad de folículos de plumas en pollos machos Wannan. Los resultados de este estudio revelan la estructura genética y la red reguladora molecular de la densidad de folículos de plumas en pollos machos Wannan, y proporcionan una base para esclarecer aún más el mecanismo regulador genético e identificar marcadores moleculares con valor en la cría.