El análisis del transcriptoma revela el desarrollo temprano en el tejido adiposo subcutáneo de lechones de Laiwu
Autores: Bian, Liwen; Di, Zhaoyang; Xu, Mengya; Tao, Yuhan; Yu, Fangyuan; Jiang, Qingyan; Yin, Yulong; Zhang, Lin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
El análisis del transcriptoma revela el desarrollo temprano en el tejido adiposo subcutáneo de lechones de Laiwu
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Tejido adiposo
Transcriptomas
Genes
Metabolismo de lípidos
Interacción proteína-proteína
Expresión específica de género
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
El tejido adiposo juega un papel importante en la eficiencia de producción porcina. Los estudios han demostrado que el desarrollo postnatal tiene un impacto vital en el tejido adiposo; sin embargo, los mecanismos detrás de la programación temprana del tejido adiposo en los cerdos siguen siendo desconocidos. En este estudio, analizamos los transcriptomas del tejido adiposo subcutáneo (SAT) de lechones Laiwu de 1 día y 21 días de edad. Los resultados mostraron que el SAT de los lechones Laiwu aumentó significativamente de 1 día a 21 días, y el análisis del transcriptoma mostró que había 2352 y 2596 genes expresados diferencialmente (DEGs) entre el SAT de 1 día y 21 días en lechones machos y hembras, respectivamente. La expresión de genes en glucólisis, gluconeogénesis y metabolismo del glucógeno, como la piruvato quinasa M1/2, la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa 1 y la amilo-alfa-1,6-glucosidasa, fueron significativamente diferentes entre el SAT de 1 día y 21 días. Los genes en la captación de lípidos, síntesis y lipólisis, como la lipasa E, la acetil-CoA carboxilasa alfa, la estearoil-CoA desaturasa y la 3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA sintetasa 1 también se expresaron diferencialmente. El análisis funcional mostró un enriquecimiento de DEGs en regulación transcripcional, metabolismo de proteínas y transducción de señales celulares. Se analizaron las redes de interacción proteína-proteína (PPI) de estos DEGs y se identificaron genes clave potenciales en estas vías, como los factores de transcripción forkhead box O4, la proteína de unión al potenciador CCAAT beta y la proteína de unión al potenciador CCAAT delta, las quinasas de señal BUB1 quinasa de serina/treonina del punto de control mitótico y la quinasa dependiente de ciclina 1, y los factores relacionados con la proteostasis, como la enzima conjugadora de ubiquitina E2 C y la catepsina D. Además, analizamos más a fondo los transcriptomas del SAT entre géneros y los resultados mostraron que había 54 y 72 DEGs en el SAT de 1 día y 21 días, respectivamente. Genes como y mostraron expresión específica de género en el SAT de 1 día y 21 días. Estos resultados mostraron los cambios significativos en el SAT entre 1 día y 21 días en cerdos Laiwu machos y hembras, lo que proporcionaría información para comprender de manera integral la programación del desarrollo temprano del tejido adiposo y regular la función del tejido adiposo.
Descripción
El tejido adiposo juega un papel importante en la eficiencia de producción porcina. Los estudios han demostrado que el desarrollo postnatal tiene un impacto vital en el tejido adiposo; sin embargo, los mecanismos detrás de la programación temprana del tejido adiposo en los cerdos siguen siendo desconocidos. En este estudio, analizamos los transcriptomas del tejido adiposo subcutáneo (SAT) de lechones Laiwu de 1 día y 21 días de edad. Los resultados mostraron que el SAT de los lechones Laiwu aumentó significativamente de 1 día a 21 días, y el análisis del transcriptoma mostró que había 2352 y 2596 genes expresados diferencialmente (DEGs) entre el SAT de 1 día y 21 días en lechones machos y hembras, respectivamente. La expresión de genes en glucólisis, gluconeogénesis y metabolismo del glucógeno, como la piruvato quinasa M1/2, la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa 1 y la amilo-alfa-1,6-glucosidasa, fueron significativamente diferentes entre el SAT de 1 día y 21 días. Los genes en la captación de lípidos, síntesis y lipólisis, como la lipasa E, la acetil-CoA carboxilasa alfa, la estearoil-CoA desaturasa y la 3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA sintetasa 1 también se expresaron diferencialmente. El análisis funcional mostró un enriquecimiento de DEGs en regulación transcripcional, metabolismo de proteínas y transducción de señales celulares. Se analizaron las redes de interacción proteína-proteína (PPI) de estos DEGs y se identificaron genes clave potenciales en estas vías, como los factores de transcripción forkhead box O4, la proteína de unión al potenciador CCAAT beta y la proteína de unión al potenciador CCAAT delta, las quinasas de señal BUB1 quinasa de serina/treonina del punto de control mitótico y la quinasa dependiente de ciclina 1, y los factores relacionados con la proteostasis, como la enzima conjugadora de ubiquitina E2 C y la catepsina D. Además, analizamos más a fondo los transcriptomas del SAT entre géneros y los resultados mostraron que había 54 y 72 DEGs en el SAT de 1 día y 21 días, respectivamente. Genes como y mostraron expresión específica de género en el SAT de 1 día y 21 días. Estos resultados mostraron los cambios significativos en el SAT entre 1 día y 21 días en cerdos Laiwu machos y hembras, lo que proporcionaría información para comprender de manera integral la programación del desarrollo temprano del tejido adiposo y regular la función del tejido adiposo.