El rendimiento del sistema de actuación de flaps afecta directamente el efecto de control y la calidad de vuelo de una aeronave. El actuador electromecánico (EMA) y el mecanismo de enlace son componentes importantes del sistema. Para lograr los objetivos de buena precisión de transmisión y respuesta dinámica, se debe considerar la influencia de las propiedades no lineales en la cadena de transmisión, incluyendo el EMA y el mecanismo de enlace. Se desarrolló un modelo de co-simulación a nivel de sistema del sistema de actuación de flaps, que tiene en cuenta los factores no lineales del EMA, la dinámica de impacto del mecanismo de enlace con holgura y las características de acoplamiento rígido-flexible. Además, se realizaron experimentos con diferentes frecuencias de comando y cargas. Se compararon los resultados de simulación y experimentales para verificar la efectividad del modelo de co-simulación. Finalmente, se discuten los efectos de las propiedades no lineales, incluyendo la rigidez de contacto y la holgura de un mecanismo de tornillo de rodillos planetarios, la rigidez de anclaje del EMA, el número de juntas con holgura, la flexibilidad y la carga. Este trabajo puede contribuir al análisis del rendimiento de un sistema multibody electromecánico con características no lineales, lo que tiene un significado académico crucial y valores de aplicación ingenieril para el desarrollo de sistemas con alta velocidad, buena fiabilidad y larga vida.