Análisis del transcriptoma muscular de la marta en diferentes etapas de crecimiento utilizando RNA-Seq
Autores: Rong, Min; Xing, Xiumei; Zhang, Ranran
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis del transcriptoma muscular de la marta en diferentes etapas de crecimiento utilizando RNA-Seq
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Mink
Expresión génica
Factores de crecimiento
Desarrollo muscular
Regulación del ciclo celular
Desarrollo embrionario
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
El visón es un tipo de recurso animal de piel pequeña y preciosa. En este estudio, empleamos tecnología de transcriptómica para analizar el perfil de expresión génica del tejido muscular pectoral del visón, elucidando así los mecanismos regulatorios subyacentes al crecimiento y desarrollo del visón. En consecuencia, se adquirieron un total de 25,954 perfiles de expresión génica a lo largo de las etapas de crecimiento y desarrollo del visón a los 45, 90 y 120 días. Entre estos perfiles, 2607 genes mostraron una expresión diferencial significativa (|log2(cambio de pliegue)| >= 2 y _adj < 0.05). Los análisis de enriquecimiento de GO y KEGG revelaron que los genes expresados diferencialmente estaban principalmente asociados con el proceso del ciclo celular mitótico, la respuesta a factores de crecimiento, el desarrollo del órgano muscular y la resistencia a la insulina. Además, el análisis de enriquecimiento de GSEA demostró un enriquecimiento significativo de genes expresados diferencialmente en la vía de señalización p53 a los 45 días de edad. El análisis subsiguiente reveló que los genes asociados con el desarrollo embrionario, la regulación del ciclo celular y la familia FGF se encontraron todos regulados al alza a los 45 días de edad en el visón, lo que sugiere un papel potencial de estos genes en la gobernanza de los procesos de crecimiento y desarrollo temprano. Por el contrario, los genes asociados con el desarrollo del músculo esquelético, un regulador negativo del ciclo celular y otros se encontraron regulados al alza a los 90 días de edad, sugiriendo su posible participación en el rápido crecimiento del visón. En resumen, nuestros datos experimentales brindan un sólido apoyo para elucidación de los mecanismos regulatorios subyacentes al crecimiento y desarrollo del visón.
Descripción
El visón es un tipo de recurso animal de piel pequeña y preciosa. En este estudio, empleamos tecnología de transcriptómica para analizar el perfil de expresión génica del tejido muscular pectoral del visón, elucidando así los mecanismos regulatorios subyacentes al crecimiento y desarrollo del visón. En consecuencia, se adquirieron un total de 25,954 perfiles de expresión génica a lo largo de las etapas de crecimiento y desarrollo del visón a los 45, 90 y 120 días. Entre estos perfiles, 2607 genes mostraron una expresión diferencial significativa (|log2(cambio de pliegue)| >= 2 y _adj < 0.05). Los análisis de enriquecimiento de GO y KEGG revelaron que los genes expresados diferencialmente estaban principalmente asociados con el proceso del ciclo celular mitótico, la respuesta a factores de crecimiento, el desarrollo del órgano muscular y la resistencia a la insulina. Además, el análisis de enriquecimiento de GSEA demostró un enriquecimiento significativo de genes expresados diferencialmente en la vía de señalización p53 a los 45 días de edad. El análisis subsiguiente reveló que los genes asociados con el desarrollo embrionario, la regulación del ciclo celular y la familia FGF se encontraron todos regulados al alza a los 45 días de edad en el visón, lo que sugiere un papel potencial de estos genes en la gobernanza de los procesos de crecimiento y desarrollo temprano. Por el contrario, los genes asociados con el desarrollo del músculo esquelético, un regulador negativo del ciclo celular y otros se encontraron regulados al alza a los 90 días de edad, sugiriendo su posible participación en el rápido crecimiento del visón. En resumen, nuestros datos experimentales brindan un sólido apoyo para elucidación de los mecanismos regulatorios subyacentes al crecimiento y desarrollo del visón.