Un Análisis Exploratorio de Datos de RNA-Seq de Ovejas y Bovinos Identifica Vías y Genes Clave Relacionados con la Dilatación Cervical
Autores: Gonçalves, Joedson Dantas; Ferraz, José Bento Sterman; Meirelles, Flávio Vieira; Nociti, Ricardo Perecin; Oliveira, Maria Emilia Franco
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Un Análisis Exploratorio de Datos de RNA-Seq de Ovejas y Bovinos Identifica Vías y Genes Clave Relacionados con la Dilatación Cervical
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Identificados
Vías
Genes
Vía PI3K/Akt
Dilatación cervical
Rumiantes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
El presente estudio desarrolló una revisión y exploración de datos en repositorios públicos y ya validados. El objetivo principal fue identificar las vías involucradas en la dilatación cervical de los rumiantes, que se conservan entre el ganado y las ovejas en las fases folicular y lútea del ciclo reproductivo. En el ganado, 1961 genes se expresaron de manera diferencial en la fase folicular y 1560 en la fase lútea. Se consideraron 24 genes expresados exclusivamente de estos. Un total de 18 genes estaban en la fase folicular y 6 genes estaban en la fase lútea. En las ovejas, 2126 genes se expresaron de manera diferencial en la fase folicular y 2469 genes se expresaron de manera diferencial en la fase lútea. Se identificaron genes Hoxb en ambas especies y están correlacionados con la vía PI3K/Akt. PI3K/Akt también se encontró en el ganado y en las ovejas, apareciendo de manera prominente en las fases folicular y lútea de ambas especies. Nuestras análisis han señalado que la vía PI3K/Akt y los genes Hoxb aparecen de manera prominente en la modulación de mecanismos que involucran alteraciones del estro en el cuello uterino. PI3K/Akt parece ser una vía importante en el proceso de relajación cervical.
Descripción
El presente estudio desarrolló una revisión y exploración de datos en repositorios públicos y ya validados. El objetivo principal fue identificar las vías involucradas en la dilatación cervical de los rumiantes, que se conservan entre el ganado y las ovejas en las fases folicular y lútea del ciclo reproductivo. En el ganado, 1961 genes se expresaron de manera diferencial en la fase folicular y 1560 en la fase lútea. Se consideraron 24 genes expresados exclusivamente de estos. Un total de 18 genes estaban en la fase folicular y 6 genes estaban en la fase lútea. En las ovejas, 2126 genes se expresaron de manera diferencial en la fase folicular y 2469 genes se expresaron de manera diferencial en la fase lútea. Se identificaron genes Hoxb en ambas especies y están correlacionados con la vía PI3K/Akt. PI3K/Akt también se encontró en el ganado y en las ovejas, apareciendo de manera prominente en las fases folicular y lútea de ambas especies. Nuestras análisis han señalado que la vía PI3K/Akt y los genes Hoxb aparecen de manera prominente en la modulación de mecanismos que involucran alteraciones del estro en el cuello uterino. PI3K/Akt parece ser una vía importante en el proceso de relajación cervical.