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Análisis de la Expresión Génica Diferencial bajo Exposición Aguda al Plomo o Mercurio en Larvas de Pez Cebra Utilizando RNA-Seq

Autores: Lu, Xing; Zhang, Lang; Lin, Gen-Mei; Lu, Jian-Guo; Cui, Zong-Bin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Análisis de la Expresión Génica Diferencial bajo Exposición Aguda al Plomo o Mercurio en Larvas de Pez Cebra Utilizando RNA-Seq


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Efectos
Exposición al plomo
Larvas
Secuenciación de ARN
Expresión génica
Pez cebra

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Este estudio se llevó a cabo inicialmente para investigar los efectos de la exposición aguda al plomo en embriones o larvas de pez cebra en desarrollo desde 24 hasta 120 horas post-fertilización (hpf). Nuestros datos mostraron que el tratamiento con 50-200 M de plomo afectó significativamente la supervivencia y morfología larval en comparación con el control respectivo. En segundo lugar, elegimos larvas de 120 hpf tratadas con 12.5 M de plomo para la secuenciación de ARN debido a que su nivel de exposición era suficiente para producir efectos tóxicos con mínima mortalidad y bioacumulación de plomo en el pez cebra en desarrollo. Se obtuvieron un total de 137.45 millones de lecturas crudas, y más del 86% de los datos limpios se mapearon al genoma de referencia del pez cebra. Los perfiles de expresión diferencial generaron 116 genes regulados al alza y 34 regulados a la baja tras la exposición al plomo. Los términos GO más enriquecidos para los DEGs representativos fueron el transporte de iones y el metabolismo de lípidos. En tercer lugar, una comparación con el conjunto de datos de expresión génica regulada por mercurio identificó 94 genes (64 regulados al alza y 30 regulados a la baja) específicos de la exposición al plomo, así como 422 genes (338 regulados al alza y 84 regulados a la baja) específicos de la exposición al mercurio. Además, 56 genes fueron co-regulados por el tratamiento con mercurio y plomo en micromolar, y la expresión de trece genes, incluyendo , , , , , , , , , , , y fue validada por qRT-PCR. Estos genes estaban principalmente asociados con la unión de iones metálicos, proteólisis, actividad antioxidante, transducción de señales, transporte de iones de calcio u oxígeno, el proceso biosintético de ácidos grasos y el metabolismo de proteínas. En conjunto, estos hallazgos ayudan a comprender mejor las respuestas a nivel genómico de los peces cebra en desarrollo al plomo o mercurio y proporcionan biomarcadores potenciales para la exposición aguda a metales tóxicos.

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