La secuenciación de alto rendimiento ha avanzado significativamente la exploración de los mecanismos inmunes de los peces, permitiendo una comprensión más detallada de las respuestas inmunitarias y sus vías moleculares subyacentes. En este estudio, aplicamos transcriptómica comparativa y secuenciación de ARN de una sola célula para investigar los mecanismos inmunes de la tilapia en respuesta a diferentes bacterias patógenas. Nuestros resultados demostraron que las células citotóxicas no específicas (NCCs) y los monocitos/macrófagos (Mos/Ms) presentaron las respuestas más pronunciadas a ambas infecciones. Además, los Mos/Ms exhibieron patrones de diferenciación distintos dependiendo del desafío bacteriano. En conjunto, estos hallazgos ofrecen nuevas perspectivas sobre las estrategias inmunitarias antibacterianas de los vertebrados inferiores.