es un animal bentónico importante en el manglar, que sirve como un organismo indicador de la contaminación ambiental costera. Este estudio tuvo como objetivo investigar la expresión específica de miARN en tejidos y sus roles regulatorios en los objetivos predichos. A través de la secuenciación de miARN y el análisis de redes de coexpresión, estudiamos extensamente la expresión de miARN en tres tejidos: branquias, hepatopáncreas y músculo. Los resultados revelaron un total de 1412 miARN, que comprenden 1047 miARN conocidos y 365 miARN predichos recientemente. Estos miARN exhibieron patrones de expresión específicos de tejido distintos. En la predicción de genes objetivo de miARN, se identificaron un total de 7404 objetivos potenciales predichos, que representan aproximadamente el 33% de todos los transcritos únicos asociados con miARN. Un análisis adicional de la red de coexpresión reveló nueve módulos, cada uno mostrando una correlación positiva con tejidos específicos (branquias, hepatopáncreas o músculo). El módulo azul mostró una correlación significativa con las branquias (r = 0.83, valor-p = 0.006), el módulo negro estuvo significativamente relacionado con el hepatopáncreas (r = 0.78, valor-p = 0.01), y el módulo púrpura estuvo significativamente correlacionado con el músculo (r = 0.83, valor-p = 0.006). Dentro de estos módulos, los miARN relacionados tendieron a agruparse, mientras que sus correlaciones con otros módulos fueron relativamente débiles. Se realizó un análisis de enriquecimiento funcional en los miARN y sus objetivos predichos en cada tejido. En las branquias, los miARN regulan principalmente genes relacionados con la inmunidad, el transporte de sustancias y la organización del citoesqueleto. En el hepatopáncreas, los miARN suprimieron genes involucrados en la formación de conchas y desempeñaron un papel en la actividad motora celular y el metabolismo. En el músculo, los miARN participan en el metabolismo y los procesos fotoreceptores, así como en la regulación inmune. En resumen, este estudio proporciona valiosos conocimientos sobre la regulación específica de tejidos de los miARN, destacando sus roles potenciales en la respuesta inmune, el metabolismo y la adaptación ambiental. Estos hallazgos ofrecen pistas importantes para comprender los mecanismos moleculares y los procesos biológicos, sentando las bases para una validación y elucidación adicionales de estas relaciones regulatorias.