Este estudio tiene como objetivo caracterizar los patrones de expresión específicos de tejidos en novillos Hanwoo mediante la identificación de módulos de coexpresión, vías funcionales y genes clave relacionados con rasgos de grasa y músculo utilizando el análisis de Red de Coexpresión Génica Ponderada (WGCNA). Se generaron datos de RNA-Seq a partir de tres tejidos musculares (músculo longissimus, solomillo y cadera) y dos tejidos adiposos (grasa dorsal y grasa abdominal) recolectados de seis novillos Hanwoo de 30 meses. Se realizó un control de calidad de las lecturas de secuenciación en bruto utilizando FastQC, y las lecturas recortadas se alinearon con el genoma de referencia bovino (ARS-UCD1.3) utilizando HISAT2. También identificamos una red de coexpresión génica utilizando valores de expresión génica normalizados. Los módulos se definieron en función de la superposición topológica y se correlacionaron con patrones de expresión específicos de tejidos. Los módulos con una asociación significativa (< 0.05) se utilizaron para el enriquecimiento funcional basado en la Ontología Génica (GO) y las vías KEGG, así como en el análisis de la Red de Interacción Proteína-Proteína. Se identificaron un total de siete módulos de coexpresión mediante WGCNA y se etiquetaron en colores distintos (amarillo, azul, rojo, marrón, turquesa, verde, negro). Entre ellos, los módulos amarillo y azul se asociaron positivamente con la grasa dorsal, mientras que los módulos turquesa y verde mostraron una correlación negativa con la grasa abdominal. Además, el módulo turquesa o verde se correlacionó positivamente con los tejidos longissimus y cadera, indicando patrones de expresión génica distintos entre grasa y músculo. Este estudio identificó módulos de coexpresión clave y genes centrales asociados con el metabolismo muscular y de grasa. Notablemente, el módulo azul estuvo involucrado en el metabolismo de lípidos y almacenamiento de energía, mientras que el módulo turquesa estuvo vinculado al mantenimiento de la estructura y función de las células musculares. Estos hallazgos revelan mecanismos biológicos para la regulación génica específica de tejidos, proporcionando objetivos para mejorar la calidad de la carne en Hanwoo.