Perfiles proteómicos de semillas enteras, cáscaras y semillas despojadas de dos cultivares de cáñamo industrial (L.)
Autores: Bárta, Jan; Roudnický, Pavel; Jaroová, Markéta; Zdráhal, Zbynk; Stupková, Adéla; Bártová, Veronika; Krejová, Zlatue; Kyselka, Jan; Filip, Vladimír; íha, Václav; Lorenc, Frantiek; Bedrníek, Jan; Smetana, Pavel
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Perfiles proteómicos de semillas enteras, cáscaras y semillas despojadas de dos cultivares de cáñamo industrial (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Semillas de cáñamo
Sin cáscara
Proteoma
Clases de proteínas
Proteínas de almacenamiento
Oleosinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Como fuente de componentes nutricionalmente importantes, las semillas de cáñamo a menudo se les quita la cáscara para su consumo y aplicaciones alimentarias, lo que aumenta su valor nutricional. Las cáscaras se convierten así en desechos, aunque pueden contener valiosos elementos proteicos, sobre los cuales hay una falta de información. Por lo tanto, el presente trabajo tiene como objetivo evaluar el proteoma de cáñamo (L.) a niveles de semilla entera, semilla descascarada y cáscara. La evaluación se realizó en dos cultivares, Santhica 27 y Uso-31, utilizando análisis de LC-MS/MS. En total, se identificaron 2833 grupos de proteínas (PGs) y se determinaron sus abundancias relativas. Se consideró un conjunto de 88 PGs cuya abundancia superó los 1000 ppm (conjunto MP88) para una evaluación adicional. Los PGs del conjunto MP88 se dividieron en diez clases de proteínas. Se encontró que las proteínas de almacenamiento de semillas eran la clase de proteínas más abundante: los promedios de los cultivares fueron 65.5%, 71.3% y 57.5% para semillas enteras, semillas descascaradas y cáscaras, respectivamente. En particular, se encontraron globulinas 11S que representan edestina (tres PGs), seguidas de proteínas similares a vicilina 7S (cuatro PGs) y albúminas 2S (dos PGs). Se encontró que las globulinas de almacenamiento 11S en Santhica 27 y Uso-31 tenían una mayor abundancia relativa en el proteoma de semillas descascaradas (sumando 58.6 y 63.2%) que en el proteoma de cáscaras (50.5 y 54%), respectivamente. La segunda clase de proteínas más abundante fue la de oleosinas, que son parte de las membranas de los cuerpos oleosos. Los PGs pertenecientes a proteínas metabólicas (por ejemplo, metabolismo energético, metabolismo de ácidos nucleicos y síntesis de proteínas) y proteínas relacionadas con la defensa y las respuestas al estrés fueron más abundantes en las cáscaras que en las semillas descascaradas. Por lo tanto, las cáscaras pueden ser una fuente esencial de proteínas, especialmente para aplicaciones médicas y biotecnológicas. El análisis proteómico ha demostrado ser una herramienta valiosa para estudiar las diferencias en la abundancia relativa de proteínas entre semillas de cáñamo descascaradas y sus cáscaras entre diferentes cultivares.
Descripción
Como fuente de componentes nutricionalmente importantes, las semillas de cáñamo a menudo se les quita la cáscara para su consumo y aplicaciones alimentarias, lo que aumenta su valor nutricional. Las cáscaras se convierten así en desechos, aunque pueden contener valiosos elementos proteicos, sobre los cuales hay una falta de información. Por lo tanto, el presente trabajo tiene como objetivo evaluar el proteoma de cáñamo (L.) a niveles de semilla entera, semilla descascarada y cáscara. La evaluación se realizó en dos cultivares, Santhica 27 y Uso-31, utilizando análisis de LC-MS/MS. En total, se identificaron 2833 grupos de proteínas (PGs) y se determinaron sus abundancias relativas. Se consideró un conjunto de 88 PGs cuya abundancia superó los 1000 ppm (conjunto MP88) para una evaluación adicional. Los PGs del conjunto MP88 se dividieron en diez clases de proteínas. Se encontró que las proteínas de almacenamiento de semillas eran la clase de proteínas más abundante: los promedios de los cultivares fueron 65.5%, 71.3% y 57.5% para semillas enteras, semillas descascaradas y cáscaras, respectivamente. En particular, se encontraron globulinas 11S que representan edestina (tres PGs), seguidas de proteínas similares a vicilina 7S (cuatro PGs) y albúminas 2S (dos PGs). Se encontró que las globulinas de almacenamiento 11S en Santhica 27 y Uso-31 tenían una mayor abundancia relativa en el proteoma de semillas descascaradas (sumando 58.6 y 63.2%) que en el proteoma de cáscaras (50.5 y 54%), respectivamente. La segunda clase de proteínas más abundante fue la de oleosinas, que son parte de las membranas de los cuerpos oleosos. Los PGs pertenecientes a proteínas metabólicas (por ejemplo, metabolismo energético, metabolismo de ácidos nucleicos y síntesis de proteínas) y proteínas relacionadas con la defensa y las respuestas al estrés fueron más abundantes en las cáscaras que en las semillas descascaradas. Por lo tanto, las cáscaras pueden ser una fuente esencial de proteínas, especialmente para aplicaciones médicas y biotecnológicas. El análisis proteómico ha demostrado ser una herramienta valiosa para estudiar las diferencias en la abundancia relativa de proteínas entre semillas de cáñamo descascaradas y sus cáscaras entre diferentes cultivares.