La deficiencia de fósforo (P) es uno de los principales factores limitantes para la productividad de los cultivos. El rendimiento del arroz (L.) está severamente limitado por la deficiencia de fósforo. En este estudio se ha intentado identificar proteínas diferencialmente expresadas en respuesta a la deficiencia de P en el arroz a través del análisis del proteoma de las hojas de cultivares de arroz contrastantes en su respuesta al P bajo condiciones de deficiencia de P, debido a que se ha encontrado variabilidad genética en los cultivares de arroz para la respuesta adaptativa a la deficiencia de P y un sistema regulador controlado está involucrado en la respuesta de adaptación a la deficiencia de P. Los cultivares de arroz eficientes en fósforo (cv. Panvel) e ineficientes en P (cv. Nagina 22) se cultivaron hidropónicamente en un medio nutriente bajo condiciones ambientales controladas a niveles de P bajos (2,0 uM) y óptimos (320 uM). Los patrones de expresión de las proteínas de las hojas de ambos cultivares se analizaron en plantas de 30 días. La identificación de estas proteínas a través de espectrometría de masas y el software MASCOT (Matrix Science Inc., Boston, USA) reveló que estas proteínas diferencialmente expresadas eran homólogas a proteínas funcionales conocidas involucradas en el metabolismo energético, biosíntesis, fotosíntesis, señalización, síntesis de proteínas, plegamiento de proteínas, metabolismo de fosfolípidos, estrés oxidativo, factores de transcripción y metabolismo de fósforo. Se observó que los cultivares de arroz respondieron de manera diferente al tratamiento con bajo P a través de la modificación en el patrón de expresión de proteínas para mantener el crecimiento de las plantas. Por lo tanto, los patrones de expresión de proteínas fueron diferentes en ambos cultivares bajo tratamiento con bajo P. Se observó un mayor potencial de estabilidad proteica, tolerancia al estrés, osmo-protección y regulación de la absorción de fósforo en el cv. Panvel que en el cv. Nagina 22. Este estudio podría ayudar a desentrañar el complejo proceso regulatorio que está involucrado en la adaptación a la deficiencia de P en el arroz.