La expansión de las áreas urbanas y el uso insostenible del suelo asociados con las actividades humanas han provocado un declive en la calidad del hábitat (HQ), especialmente en regiones áridas con ecosistemas frágiles. Una predicción precisa de los cambios en el uso del suelo y la calidad del hábitat a través de diferentes escenarios es crucial para el mantenimiento sostenible de la diversidad ecológica. En este artículo, se empleó el modelo InVEST para evaluar tanto la calidad como los niveles de degradación de los hábitats en la Cuenca Turpan-Hami (THB) desde 1990 hasta 2020. Además, se utilizó el modelo acoplado InVEST-PLUS para prever las condiciones del hábitat bajo tres escenarios diferentes en 2050. Específicamente, se trató de la comparación de los cambios en el uso del suelo y la distribución espacial de HQ a través de escenarios de desarrollo natural (ND), escenarios de desarrollo urbano (UD) y escenarios de protección ecológica (EP), junto con el análisis de puntos críticos de HQ desde 1990 hasta 2050. Los resultados revelaron lo siguiente: (1) El uso principal del suelo en la THB se categorizó como tierra no utilizada, junto con notables expansiones en tierras cultivadas, pastizales y tierras construidas. Por el contrario, se observó un considerable declive en bosques, cuerpos de agua y tierras no utilizadas entre 1990 y 2020. (2) La HQ dentro de la THB exhibió evidentes características de agrupamiento espacial. Entre 1990 y 2020, las áreas con baja HQ representaron más del 85%, las áreas con HQ sin cambios constituyeron el 88.19%, las áreas que experimentaron una HQ deteriorada comprendieron aproximadamente el 5.02%, y las áreas que mostraron una HQ mejorada abarcaron alrededor del 6.79%. (3) A través de la comparación de HQ para los escenarios ND, UD y EP en 2050, se observó que la HQ promedio bajo el escenario EP ocupó el primer lugar, exhibiendo el menor grado de degradación en promedio. Esto indica que el escenario EP es el más ventajoso para preservar la HQ. En conclusión, esta investigación proporciona puntos de vista valiosos para tomar decisiones destinadas a mejorar la HQ en regiones áridas ecológicamente frágiles.