Un análisis de la polimorfismo de secuencia de ADN en el gen del receptor tipo Toll del búfalo de pantano
Autores: Kenchaiwong, Wootichai; Pongthaisong, Pongphol; Kananit, Srinuan; Duangjinda, Monchai; Boonkum, Wuttigrai
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Un análisis de la polimorfismo de secuencia de ADN en el gen del receptor tipo Toll del búfalo de pantano
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Receptores tipo Toll
Respuestas inmunitarias
Polimorfismo de un solo nucleótido
TLR2
Diversidad genética
Análisis de haplotipos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los receptores tipo Toll (TLRs) son proteínas transmembrana importantes para dirigir las respuestas inmunitarias. Su función principal es reconocer patógenos basándose en características de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). El TLR2 se clasifica como un receptor de reconocimiento de patrones (PRR) que es importante para el reconocimiento de patógenos. La variación de nucleótidos en la región codificante determina la conformación de la proteína TLR, afectando su eficiencia en el dominio proteico. Este estudio tuvo como objetivo identificar SNPs en la región codificante para mejorar las herramientas genéticas disponibles para mejorar la salud y la producción en búfalos de agua. Se muestrearon aleatoriamente un total de 50 búfalos de la parte noreste de Tailandia para la extracción y secuenciación de ADN genómico. Las secuencias de nucleótidos se alinearon y compararon con las de ganado vacuno y búfalos de río basándose en la base de datos. Los resultados mostraron que había 29 ubicaciones de SNP en búfalos de agua y 14 ubicaciones diferentes en ganado vacuno y búfalos. El análisis de haplotipos reveló que ocurrieron 27 haplotipos. Se identificaron búfalos de agua a partir de 13 SNPs basándose en el análisis bialélico, que encontró ocho SNPs sinónimos y cinco no sinónimos. La diversidad de nucleótidos fue de 0.16, lo que indica diversidad genética. La diversidad genética (diversidad de haplotipos; HD) fue alta, con un valor de 0.99 +/- 0.04. Esto indica una alta probabilidad de que los dos haplotipos de muestra sean diferentes. Los valores de y HD son indicadores importantes de la diversidad genética de la población de búfalos de agua. En resumen, la población de búfalos de agua tailandeses detectó un polimorfismo en la región codificante del gen. Por lo tanto, se recomienda un estudio más profundo sobre la relación entre estos genes en el sistema inmunológico y la resistencia a enfermedades.
Descripción
Los receptores tipo Toll (TLRs) son proteínas transmembrana importantes para dirigir las respuestas inmunitarias. Su función principal es reconocer patógenos basándose en características de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). El TLR2 se clasifica como un receptor de reconocimiento de patrones (PRR) que es importante para el reconocimiento de patógenos. La variación de nucleótidos en la región codificante determina la conformación de la proteína TLR, afectando su eficiencia en el dominio proteico. Este estudio tuvo como objetivo identificar SNPs en la región codificante para mejorar las herramientas genéticas disponibles para mejorar la salud y la producción en búfalos de agua. Se muestrearon aleatoriamente un total de 50 búfalos de la parte noreste de Tailandia para la extracción y secuenciación de ADN genómico. Las secuencias de nucleótidos se alinearon y compararon con las de ganado vacuno y búfalos de río basándose en la base de datos. Los resultados mostraron que había 29 ubicaciones de SNP en búfalos de agua y 14 ubicaciones diferentes en ganado vacuno y búfalos. El análisis de haplotipos reveló que ocurrieron 27 haplotipos. Se identificaron búfalos de agua a partir de 13 SNPs basándose en el análisis bialélico, que encontró ocho SNPs sinónimos y cinco no sinónimos. La diversidad de nucleótidos fue de 0.16, lo que indica diversidad genética. La diversidad genética (diversidad de haplotipos; HD) fue alta, con un valor de 0.99 +/- 0.04. Esto indica una alta probabilidad de que los dos haplotipos de muestra sean diferentes. Los valores de y HD son indicadores importantes de la diversidad genética de la población de búfalos de agua. En resumen, la población de búfalos de agua tailandeses detectó un polimorfismo en la región codificante del gen. Por lo tanto, se recomienda un estudio más profundo sobre la relación entre estos genes en el sistema inmunológico y la resistencia a enfermedades.