El análisis omics integral revela la reprogramación metabólica inducida por el frío y el empalme alternativo en
Autores: Zhan, Xinqiao; Li, Zhangqun; Pang, Minxia; Yao, Guoxiang; Mao, Bizeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
El análisis omics integral revela la reprogramación metabólica inducida por el frío y el empalme alternativo en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Orquídea
Estrés frío
Mecanismos metabólicos
Metabolismo de la glicina
Metabolismo de carbohidratos
Empalme alternativo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
es una especie de orquídea de importancia económica que es sensible al estrés por frío. Comprender los mecanismos moleculares y metabólicos subyacentes a su respuesta al frío es crucial para desarrollar estrategias que mejoren su tolerancia al frío. En este estudio, construimos un conjunto de datos integral sobre la respuesta al estrés por frío y caracterizamos su paisaje regulador en respuesta a diversas condiciones de estrés por frío. Los genes relacionados con el metabolismo de la glicina desempeñan roles fundamentales tanto en la adaptación al estrés por frío como en el estrés por sequía, y su expresión no se ve aumentada por hormonas o infecciones fúngicas. El metabolismo de carbohidratos mostró cambios dinámicos específicos en las células con lesiones por congelación, lo que involucró una variedad de respuestas hormonales. La abundancia de esfingolípidos fue notablemente mayor en el tratamiento de congelación (FT) en comparación con las plantas en recuperación de congelación (FR), lo que indica adaptaciones metabólicas especializadas a diferentes intensidades de frío. Un análisis de empalme alternativo (AS) identificó 368 genes DAS, con vías del spliceosoma significativamente enriquecidas. Se encontraron tres proteínas clave de ubiquitinación (PKU64802, XP_020672210 y PKU75555) que regulan factores de empalme, los cuales mostraron una mayor abundancia en el estrés por frío. Este estudio destaca los roles de la reprogramación metabólica y el empalme de ARN en la adaptación al frío, revelando una compleja red molecular activada en respuesta al estrés por frío.
Descripción
es una especie de orquídea de importancia económica que es sensible al estrés por frío. Comprender los mecanismos moleculares y metabólicos subyacentes a su respuesta al frío es crucial para desarrollar estrategias que mejoren su tolerancia al frío. En este estudio, construimos un conjunto de datos integral sobre la respuesta al estrés por frío y caracterizamos su paisaje regulador en respuesta a diversas condiciones de estrés por frío. Los genes relacionados con el metabolismo de la glicina desempeñan roles fundamentales tanto en la adaptación al estrés por frío como en el estrés por sequía, y su expresión no se ve aumentada por hormonas o infecciones fúngicas. El metabolismo de carbohidratos mostró cambios dinámicos específicos en las células con lesiones por congelación, lo que involucró una variedad de respuestas hormonales. La abundancia de esfingolípidos fue notablemente mayor en el tratamiento de congelación (FT) en comparación con las plantas en recuperación de congelación (FR), lo que indica adaptaciones metabólicas especializadas a diferentes intensidades de frío. Un análisis de empalme alternativo (AS) identificó 368 genes DAS, con vías del spliceosoma significativamente enriquecidas. Se encontraron tres proteínas clave de ubiquitinación (PKU64802, XP_020672210 y PKU75555) que regulan factores de empalme, los cuales mostraron una mayor abundancia en el estrés por frío. Este estudio destaca los roles de la reprogramación metabólica y el empalme de ARN en la adaptación al frío, revelando una compleja red molecular activada en respuesta al estrés por frío.