El análisis multiómico revela la red reguladora transcripcional de las raíces de maíz en respuesta a la disponibilidad de nitrógeno
Autores: Fang, Shuai; Ji, Minggang; Zhu, Tianze; Wang, Yunyun; Tang, Xiao; Zhu, Xinjie; Yang, Zefeng; Xu, Chenwu; Wang, Houmiao; Li, Pengcheng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
El análisis multiómico revela la red reguladora transcripcional de las raíces de maíz en respuesta a la disponibilidad de nitrógeno
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Nitrógeno
Disponibilidad
Maíz
Genes
Transcripción
Traducción
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
La disponibilidad de nitrógeno (N) determina la productividad y el rendimiento de las plantas superiores. Sin embargo, los mecanismos moleculares que rigen la adquisición y utilización de N siguen siendo en su mayoría desconocidos en el maíz. En este estudio, se realizaron análisis de ATAC-seq, RNA-seq y Ribo-seq en raíces de maíz bajo diferentes condiciones de suministro de N. Se destacó un conjunto de genes diferencialmente expresados en metabolismo de N y fenilpropanoides a nivel de transcripción y traducción. Curiosamente, menos de la mitad de los genes sensibles a bajo N se compartieron entre la transcripción y la traducción. La alteración de la eficiencia de traducción (TE) también es un mecanismo importante mediante el cual el maíz responde a LN. Además, identificamos regiones de cromatina abierta inducidas por bajo N (OCRs) y observamos un enriquecimiento de motivos de unión de factores de transcripción (TF). Además, construimos una red de regulación transcripcional para raíces de maíz sometidas a bajo N. Estos hallazgos amplían nuestra comprensión de la respuesta a la disponibilidad de N y proporcionan nuevas perspectivas para mejorar la eficiencia de uso de N (NUE).
Descripción
La disponibilidad de nitrógeno (N) determina la productividad y el rendimiento de las plantas superiores. Sin embargo, los mecanismos moleculares que rigen la adquisición y utilización de N siguen siendo en su mayoría desconocidos en el maíz. En este estudio, se realizaron análisis de ATAC-seq, RNA-seq y Ribo-seq en raíces de maíz bajo diferentes condiciones de suministro de N. Se destacó un conjunto de genes diferencialmente expresados en metabolismo de N y fenilpropanoides a nivel de transcripción y traducción. Curiosamente, menos de la mitad de los genes sensibles a bajo N se compartieron entre la transcripción y la traducción. La alteración de la eficiencia de traducción (TE) también es un mecanismo importante mediante el cual el maíz responde a LN. Además, identificamos regiones de cromatina abierta inducidas por bajo N (OCRs) y observamos un enriquecimiento de motivos de unión de factores de transcripción (TF). Además, construimos una red de regulación transcripcional para raíces de maíz sometidas a bajo N. Estos hallazgos amplían nuestra comprensión de la respuesta a la disponibilidad de N y proporcionan nuevas perspectivas para mejorar la eficiencia de uso de N (NUE).