Análisis microbiológico y perfilado metagenómico de la comunidad bacteriana de un suelo antropogénico modificado a partir de Haploxererts típicos
Autores: Barbaccia, Pietro; Dazzi, Carmelo; Franciosi, Elena; Di Gerlando, Rosalia; Settanni, Luca; Lo Papa, Giuseppe
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Análisis microbiológico y perfilado metagenómico de la comunidad bacteriana de un suelo antropogénico modificado a partir de Haploxererts típicos
Categoría
Ciencias Medioambientales
Subcategoría
Ciencias medioambientales generales
Palabras clave
Caracterizar
Comunidades microbianas
Suelo antropogénico
Pedotécnicas
Vertisoles
Ambiente mediterráneo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 2
Citaciones: Sin citaciones
Este trabajo tuvo como objetivo caracterizar las comunidades microbianas de un suelo antropogénico originado por la aplicación de pedotécnicas a Vertisoles en un entorno mediterráneo. Se muestrearon perfiles de suelo desnudo a tres profundidades (0-10 cm, 10-30 cm y 30-50 cm) y se compararon con el suelo original no transformado a las mismas profundidades. Los suelos antropogénicos se caracterizaron por una mayor concentración de CaCO3 (360-640 g/kg) que el suelo de control (190-200 g/kg), mientras que se registró una tendencia opuesta para la arcilla, donde el suelo de control mostró una mayor concentración (465 g/kg de media) que el suelo antropogénico (355 g/kg de media). El contenido de carbono orgánico fue mucho mayor en el suelo no transformado. Todas las muestras fueron investigadas microbiológicamente utilizando un enfoque combinado dependiente e independiente de cultivos. Cada pedón mostró un nivel generalmente decreciente con la profundidad del suelo para los varios grupos microbianos investigados; en particular, los hongos filamentosos estaban por debajo del límite de detección a 30-50 cm. Para aislar bacterias involucradas activamente en la agregación de partículas del suelo, se diferenciaron colonias con apariencia mucosa a nivel de cepa e identificaron genéticamente: los principales grupos estaban representados por Bacillus y Pseudomonas. El análisis MiSeq Illumina identificó Actinobacteria y Firmicutes como los grupos principales. Se encontró una alta variabilidad microbiana en los tres pedones antropogénicos y los microorganismos constituyen una comunidad madura.
Descripción
Este trabajo tuvo como objetivo caracterizar las comunidades microbianas de un suelo antropogénico originado por la aplicación de pedotécnicas a Vertisoles en un entorno mediterráneo. Se muestrearon perfiles de suelo desnudo a tres profundidades (0-10 cm, 10-30 cm y 30-50 cm) y se compararon con el suelo original no transformado a las mismas profundidades. Los suelos antropogénicos se caracterizaron por una mayor concentración de CaCO3 (360-640 g/kg) que el suelo de control (190-200 g/kg), mientras que se registró una tendencia opuesta para la arcilla, donde el suelo de control mostró una mayor concentración (465 g/kg de media) que el suelo antropogénico (355 g/kg de media). El contenido de carbono orgánico fue mucho mayor en el suelo no transformado. Todas las muestras fueron investigadas microbiológicamente utilizando un enfoque combinado dependiente e independiente de cultivos. Cada pedón mostró un nivel generalmente decreciente con la profundidad del suelo para los varios grupos microbianos investigados; en particular, los hongos filamentosos estaban por debajo del límite de detección a 30-50 cm. Para aislar bacterias involucradas activamente en la agregación de partículas del suelo, se diferenciaron colonias con apariencia mucosa a nivel de cepa e identificaron genéticamente: los principales grupos estaban representados por Bacillus y Pseudomonas. El análisis MiSeq Illumina identificó Actinobacteria y Firmicutes como los grupos principales. Se encontró una alta variabilidad microbiana en los tres pedones antropogénicos y los microorganismos constituyen una comunidad madura.