El -metiladenosina (mA) es una modificación interna prevalente en el ARNm eucariota, tARN, miARN y ARN largo no codificante. También es conocida por su papel en las respuestas de las plantas a estrés biótico y abiótico. Sin embargo, actualmente no hay un mapa transcriptómico completo de mA para infecciones de f. sp. () en trigo (). Nuestro estudio es el primero en perfilar las modificaciones de mA en trigo infectado con una raza virulenta. El análisis de datos de RNA-seq y MeRIP-seq reveló que la mayoría de los genes diferencialmente expresados están regulados al alza y son hipermetilados. Algunos de estos genes están enriquecidos en la vía de interacción planta-patógeno. Notablemente, los genes relacionados con la fotosíntesis mostraron una significativa regulación a la baja y hipometilación, sugiriendo un posible mecanismo que facilita la invasión exitosa al afectar la función fotosintética. Los genes cruciales, que representan los componentes moleculares centrales que refuerzan a las plantas contra ataques patogénicos, fueron detectados con niveles de expresión y metilación variables, junto con un nuevo motivo de metilación identificado. Además, los genes reguladores de mA también fueron influenciados por la modificación de mA, y sus patrones de expresión variaron en diferentes momentos post-inoculación, con una menor expresión en las primeras etapas de la infección. Este estudio proporciona información sobre el papel de la regulación de la modificación de mA en la respuesta del trigo a la infección, estableciendo una base para comprender la función potencial de la metilación de ARN mA en la resistencia o susceptibilidad de las plantas a patógenos.