En este estudio, se seleccionaron cuatro bacterias altamente eficientes en la degradación de proteínas (, , , y sp. (en: Firmicutes)) de suelo y lechos de fermentación, y se prepararon en un agente microbiano mixto en una proporción de 1:1:1:1. Se estudiaron los efectos de la inoculación con bacterias funcionales degradadoras de proteínas en la tasa de transformación de nitrógeno, la comunidad microbiana y los genes funcionales durante el compostaje de estiércol de pollo-cáscara de arroz. Con la adición de agentes funcionales, la pérdida de nitrógeno en el compostaje de estiércol de pollo se redujo al 17.05%, y las emisiones de amoníaco también disminuyeron. Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Cocci y Actinobacteria se convirtieron en las comunidades bacterianas dominantes, representando el 85.41%~98.52% de la comunidad bacteriana general en el compost; promovió el crecimiento de microorganismos como y en el compost. El análisis metagenómico reveló que la adición de agentes bacterianos funcionales mejoró la expresión de genes de fijación de nitrógeno (K, H y A) durante la fase de alta temperatura, aumentó la diversidad de bacterias asociadas con el ciclo del nitrógeno en el compost, y mejoró la absorción y fijación de elementos fuente de nitrógeno por los microorganismos. Además, fortaleció la correlación entre las comunidades microbianas, el ambiente de compostaje y los genes funcionales. Este estudio proporciona una base teórica para la aplicación eficiente de agentes microbianos y la reducción de la contaminación en el compostaje de estiércol de pollo.