El yak es una especie única de ganado que se encuentra en la meseta de Qinghai-Tíbet y sus áreas circundantes. Debido a factores como la madurez sexual tardía y una baja tasa de estro, su eficiencia reproductiva es relativamente baja. El proceso de sincronización del estro en los yaks juega un papel crucial en la mejora de su éxito reproductivo y en asegurar la continuidad de su especie. Para aclarar las características de los metabolitos séricos de la sincronización del estro en yaks, se compararon los yaks con ovarios inactivos con los yaks en sincronización de estro. En este estudio, los yaks se dividieron en el grupo de ovarios inactivos (IO), el grupo de estro inducido por gonarelina (GnRH) y el grupo de estro inducido por cloprostenol sódico (PGF). Después de completar el tratamiento de sincronización del estro, se recolectaron muestras de sangre de las venas yugulares de los yaks no en estro del grupo de control y de los yaks con características evidentes de estro en los grupos GnRH y PGF. Los metabolitos se detectaron mediante cromatografía líquida de ultra alto rendimiento-espectrometría de masas, y se seleccionaron metabolitos diferenciales mediante análisis estadístico multivariado. Los resultados mostraron que se seleccionaron e identificaron un total de 70 metabolitos diferenciales significativos en el grupo GnRH vs. IO, y 77 metabolitos diferenciales significativos en el grupo PGF vs. IO. En comparación con los yaks no en estro, se seleccionaron 36 metabolitos diferenciales significativos comunes después de la inducción del estro en yaks por gonarelina (GnRH) y cloprostenol sódico (PGF), que se enriquecieron significativamente en vías de señalización como la beta oxidación de ácidos grasos de cadena muy larga, biosíntesis de ácidos biliares, oxidación de ácidos grasos de cadena ramificada, esteroidogénesis, biosíntesis de esteroides y metabolismo de arginina y prolina. Este estudio analizó los efectos de la hormona liberadora de gonadotropinas (GnRH) y del prostaglandina F (PGF) sobre el rendimiento reproductivo de los yaks tratados con sincronización del estro, lo que proporciona una base teórica para la optimización y aplicación de la tecnología de sincronización del estro en yaks y promueve el desarrollo saludable de la industria del yak.