La altura de la planta (PH) y la altura de la mazorca (EH) están estrechamente relacionadas con las características de plantación densa y la resistencia a la lodging del maíz (L.). Aumentar la densidad de siembra conducirá a cambios en las características estructurales de las plantas de maíz, como la reducción de la longitud del tallo y la resistencia del tallo, lo que influirá en su rendimiento y calidad. Por lo tanto, analizar la base genética de PH y EH en el maíz puede proporcionar información valiosa para cultivar tipos de plantas ideales con PH y EH adecuados. Este estudio tiene como objetivo identificar regiones genómicas estables y genes candidatos asociados con PH y EH en el maíz a través del análisis de Meta-QTL (MQTL). Se recopilaron un total de 187 QTL originales de 13 artículos publicados sobre la localización de QTL relacionados con PH y EH del maíz. Se construyó un mapa de consistencia de alta densidad con una longitud total de 6970.00 cM, y 152 QTL originales se proyectaron con éxito en el mapa de consistencia. Los 35 QTL restantes no pudieron ser proyectados en el mapa de consistencia, lo que puede atribuirse a la falta de marcadores comunes entre el mapa original y el mapa de consistencia o a que el QTL exhibe una baja varianza fenotípica explicada (PVE), lo que resulta en amplios intervalos de confianza (CIs). Luego, se identificaron 29 MQTL en 10 cromosomas a través de un meta-análisis. Entre ellos, los tres MQTL identificados, es decir, MQTL4-1, MQTL4-2 y MQTL6-1, fueron controlados específicamente por EH del maíz. Un análisis adicional logró 188 genes candidatos en todos los intervalos de MQTL, que estaban relacionados con el desarrollo y la morfogénesis de las plantas de maíz. Mientras tanto, el análisis de enriquecimiento de la ontología genética (GO) reveló que estos genes candidatos estaban involucrados en 77 anotaciones de GO. Estos hallazgos ayudarán a comprender mejor la base genética molecular de PH y EH del maíz en diversos entornos, y así lograr un aumento en el rendimiento con la cría de maíz de plantación densa.