Análisis Integrado de lncRNA y mRNA en el Tejido Adiposo Subcutáneo del Cerdo Ningxiang
Autores: Gong, Yan; He, Jun; Li, Biao; Xiao, Yu; Zeng, Qinghua; Xu, Kang; Duan, Yehui; He, Jianhua; Ma, Haiming
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Análisis Integrado de lncRNA y mRNA en el Tejido Adiposo Subcutáneo del Cerdo Ningxiang
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Cerdos ningxiang
Lncrna
Mrna
Tejido adiposo subcutáneo
ácidos grasos
Perfiles de transcripción
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 29
Citaciones: Sin citaciones
Los cerdos Ningxiang, una raza de cerdo china conocida por su carne tierna y su alta calidad de ácidos grasos insaturados. Este estudio descubre los perfiles de transcripción y las redes funcionales en el ARN no codificante largo (lncRNA) y el ARN mensajero (mRNA) en el tejido adiposo subcutáneo. Se recolectó tejido adiposo subcutáneo de lechones, cerdos en la etapa de crianza, en la fase de engorde temprana y en la fase de engorde tardía de los lechones Ningxiang, y se perfiló la transcripción de lncRNA y mRNA en cada etapa. Se generaron un total de 339,204,926 (lechón), 315,609,246 (crianza), 266,798,202 (engorde temprano) y 343,740,308 (engorde tardío) lecturas limpias, y se identificaron 2872 nuevos lncRNAs. Además, se determinaron 10,084 mRNAs diferenciales (DEmRNAs) y 931 lncRNAs diferenciales. La mayoría de los DEmRNAs estaban regulados al alza en la etapa de lechón, mientras que estaban regulados a la baja en la etapa de engorde tardío. Se identificó una interacción complicada entre mRNAs y lncRNAs a través de STEM y WGCNA, lo que demostró que los lncRNAs son un componente regulador significativo en los mRNAs. Los hallazgos mostraron que los módulos 2 y 5 tienen un modo de transcripción similar tanto para mRNA como para lncRNA, y participaron principalmente en la biosíntesis de esteroides, la biosíntesis de glicoesfingolípidos, las vías metabólicas y el metabolismo de glicerolípidos. Los niveles de transcripción de mRNAs y lncRNAs de ambos módulos fueron más altos en la etapa de engorde temprana y tardía, lo que puede deberse a la actividad activa del metabolismo en relación con los ácidos grasos, esteroles, esteroides y lípidos en el tejido adiposo subcutáneo durante la etapa de engorde temprana y tardía. Se espera que estos hallazgos den lugar a una investigación adicional sobre las propiedades funcionales del lncRNA del tejido adiposo subcutáneo en diferentes etapas de desarrollo en los cerdos Ningxiang.
Descripción
Los cerdos Ningxiang, una raza de cerdo china conocida por su carne tierna y su alta calidad de ácidos grasos insaturados. Este estudio descubre los perfiles de transcripción y las redes funcionales en el ARN no codificante largo (lncRNA) y el ARN mensajero (mRNA) en el tejido adiposo subcutáneo. Se recolectó tejido adiposo subcutáneo de lechones, cerdos en la etapa de crianza, en la fase de engorde temprana y en la fase de engorde tardía de los lechones Ningxiang, y se perfiló la transcripción de lncRNA y mRNA en cada etapa. Se generaron un total de 339,204,926 (lechón), 315,609,246 (crianza), 266,798,202 (engorde temprano) y 343,740,308 (engorde tardío) lecturas limpias, y se identificaron 2872 nuevos lncRNAs. Además, se determinaron 10,084 mRNAs diferenciales (DEmRNAs) y 931 lncRNAs diferenciales. La mayoría de los DEmRNAs estaban regulados al alza en la etapa de lechón, mientras que estaban regulados a la baja en la etapa de engorde tardío. Se identificó una interacción complicada entre mRNAs y lncRNAs a través de STEM y WGCNA, lo que demostró que los lncRNAs son un componente regulador significativo en los mRNAs. Los hallazgos mostraron que los módulos 2 y 5 tienen un modo de transcripción similar tanto para mRNA como para lncRNA, y participaron principalmente en la biosíntesis de esteroides, la biosíntesis de glicoesfingolípidos, las vías metabólicas y el metabolismo de glicerolípidos. Los niveles de transcripción de mRNAs y lncRNAs de ambos módulos fueron más altos en la etapa de engorde temprana y tardía, lo que puede deberse a la actividad activa del metabolismo en relación con los ácidos grasos, esteroles, esteroides y lípidos en el tejido adiposo subcutáneo durante la etapa de engorde temprana y tardía. Se espera que estos hallazgos den lugar a una investigación adicional sobre las propiedades funcionales del lncRNA del tejido adiposo subcutáneo en diferentes etapas de desarrollo en los cerdos Ningxiang.