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Análisis Integrado de lncRNA y mRNA en el Tejido Adiposo Subcutáneo del Cerdo Ningxiang

Autores: Gong, Yan; He, Jun; Li, Biao; Xiao, Yu; Zeng, Qinghua; Xu, Kang; Duan, Yehui; He, Jianhua; Ma, Haiming

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2021

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Acceso abierto

Artículo científico
2021

Análisis Integrado de lncRNA y mRNA en el Tejido Adiposo Subcutáneo del Cerdo Ningxiang


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Cerdos ningxiang
Lncrna
Mrna
Tejido adiposo subcutáneo
ácidos grasos
Perfiles de transcripción

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 29

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los cerdos Ningxiang, una raza de cerdo china conocida por su carne tierna y su alta calidad de ácidos grasos insaturados. Este estudio descubre los perfiles de transcripción y las redes funcionales en el ARN no codificante largo (lncRNA) y el ARN mensajero (mRNA) en el tejido adiposo subcutáneo. Se recolectó tejido adiposo subcutáneo de lechones, cerdos en la etapa de crianza, en la fase de engorde temprana y en la fase de engorde tardía de los lechones Ningxiang, y se perfiló la transcripción de lncRNA y mRNA en cada etapa. Se generaron un total de 339,204,926 (lechón), 315,609,246 (crianza), 266,798,202 (engorde temprano) y 343,740,308 (engorde tardío) lecturas limpias, y se identificaron 2872 nuevos lncRNAs. Además, se determinaron 10,084 mRNAs diferenciales (DEmRNAs) y 931 lncRNAs diferenciales. La mayoría de los DEmRNAs estaban regulados al alza en la etapa de lechón, mientras que estaban regulados a la baja en la etapa de engorde tardío. Se identificó una interacción complicada entre mRNAs y lncRNAs a través de STEM y WGCNA, lo que demostró que los lncRNAs son un componente regulador significativo en los mRNAs. Los hallazgos mostraron que los módulos 2 y 5 tienen un modo de transcripción similar tanto para mRNA como para lncRNA, y participaron principalmente en la biosíntesis de esteroides, la biosíntesis de glicoesfingolípidos, las vías metabólicas y el metabolismo de glicerolípidos. Los niveles de transcripción de mRNAs y lncRNAs de ambos módulos fueron más altos en la etapa de engorde temprana y tardía, lo que puede deberse a la actividad activa del metabolismo en relación con los ácidos grasos, esteroles, esteroides y lípidos en el tejido adiposo subcutáneo durante la etapa de engorde temprana y tardía. Se espera que estos hallazgos den lugar a una investigación adicional sobre las propiedades funcionales del lncRNA del tejido adiposo subcutáneo en diferentes etapas de desarrollo en los cerdos Ningxiang.

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