Análisis in silico de genes mediadores de miARN en la regulación del desarrollo de los testículos de perro de la forma inmadura a la forma adulta
Autores: Kasimanickam, Vanmathy R.; Kasimanickam, Ramanathan K.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis in silico de genes mediadores de miARN en la regulación del desarrollo de los testículos de perro de la forma inmadura a la forma adulta
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Proteínas
Interacción proteína-proteína
Genes mediadores de miARN
Desarrollo de testículos
Análisis in-silico
Funciones biológicas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Las técnicas in-silico de alto rendimiento nos ayudan a entender el papel de proteínas individuales, la interacción proteína-proteína y sus funciones biológicas al corroborar datos experimentales como redes biológicas ejemplificadas. El objetivo de esta investigación fue elucidar la asociación de genes mediadores de miARN en la regulación del desarrollo de los testículos de perro desde la forma inmadura hasta la adulta mediante análisis in-silico. Se utilizaron miARNs de testículo canino expresados diferencialmente (DE) entre perros sanos inmaduros (2.2 +/- 0.13 meses; n = 4) y maduros (11 +/- 1.0 meses; n = 4) en esta investigación. El análisis in silico se realizó utilizando los programas miRNet, STRING y ClueGo. Se estudiaron las expresiones de mARN y proteínas de genes clave predichos y su asociación con miARN. Los resultados mostraron interacción proteína-proteína para los miARNs sobreexpresados, que revelaron 978 términos de procesos biológicos enriquecidos de GO y 127 vías de enriquecimiento de KEGG, y para los miARNs subexpresados revelaron 405 términos de procesos biológicos enriquecidos de GO y 72 vías de enriquecimiento de KEGG significativas (Tasa de Recuperación Falsa, < 0.05). El análisis in-silico de los genes asociados a los miARNs DE reveló su participación en la regulación de varias funciones biológicas clave (ciclo celular, proliferación celular, crecimiento, maduración, supervivencia y apoptosis) en los testículos a medida que evolucionan de formas inmaduras a adultas, mediadas por varias vías de señalización clave (ErbB, p53, PI3K-Akt, VEGF y JAK-STAT), citoquinas y hormonas (estrógeno, GnRH, relaxina, hormona tiroidea y prolactina). La elucidación de los roles específicos de los genes predichos por los miARNs DE, las vías de transducción de señales y los mecanismos, mediante miméticos e inhibidores, podrían quizás ofrecer objetivos diagnósticos y terapéuticos para la infertilidad, el cáncer y el control de la natalidad.
Descripción
Las técnicas in-silico de alto rendimiento nos ayudan a entender el papel de proteínas individuales, la interacción proteína-proteína y sus funciones biológicas al corroborar datos experimentales como redes biológicas ejemplificadas. El objetivo de esta investigación fue elucidar la asociación de genes mediadores de miARN en la regulación del desarrollo de los testículos de perro desde la forma inmadura hasta la adulta mediante análisis in-silico. Se utilizaron miARNs de testículo canino expresados diferencialmente (DE) entre perros sanos inmaduros (2.2 +/- 0.13 meses; n = 4) y maduros (11 +/- 1.0 meses; n = 4) en esta investigación. El análisis in silico se realizó utilizando los programas miRNet, STRING y ClueGo. Se estudiaron las expresiones de mARN y proteínas de genes clave predichos y su asociación con miARN. Los resultados mostraron interacción proteína-proteína para los miARNs sobreexpresados, que revelaron 978 términos de procesos biológicos enriquecidos de GO y 127 vías de enriquecimiento de KEGG, y para los miARNs subexpresados revelaron 405 términos de procesos biológicos enriquecidos de GO y 72 vías de enriquecimiento de KEGG significativas (Tasa de Recuperación Falsa, < 0.05). El análisis in-silico de los genes asociados a los miARNs DE reveló su participación en la regulación de varias funciones biológicas clave (ciclo celular, proliferación celular, crecimiento, maduración, supervivencia y apoptosis) en los testículos a medida que evolucionan de formas inmaduras a adultas, mediadas por varias vías de señalización clave (ErbB, p53, PI3K-Akt, VEGF y JAK-STAT), citoquinas y hormonas (estrógeno, GnRH, relaxina, hormona tiroidea y prolactina). La elucidación de los roles específicos de los genes predichos por los miARNs DE, las vías de transducción de señales y los mecanismos, mediante miméticos e inhibidores, podrían quizás ofrecer objetivos diagnósticos y terapéuticos para la infertilidad, el cáncer y el control de la natalidad.