Se realizó un análisis de correlación y espectros cruzados de hidrogramas en el área kárstica de la sección montañosa del río Kupa en dos períodos de tiempo. Dado que hay acuíferos kársticos en esta área que forma parte de las reservas estratégicas de agua subterránea potable, dicho análisis podría proporcionar una mejor comprensión del comportamiento de estos acuíferos. Las funciones utilizadas para describir los acuíferos kársticos son la función de correlación cruzada, la función de coherencia, la función de ganancia y la función de fase. Los resultados del análisis fueron muy similares en los dos períodos analizados, lo que sugiere que las diferencias en las señales de entrada entre estos dos períodos no afectan la función del acuífero como un filtro del sistema. Los resultados de esta investigación sugieren que las características del acuífero y de la capa de sobrecarga tienen una influencia mucho más fuerte que el cambio de la señal de entrada en el régimen de escorrentía en el período considerado.