El maíz (L.) es uno de los cultivos más cruciales para la seguridad alimentaria mundial. Por esta razón, se han realizado muchos esfuerzos para abordar la utilización eficiente de las colecciones de germoplasma. En este estudio, se utilizaron 322 líneas puras para vincular variaciones genotípicas (53,403 bloques de haplotipos (HBs) y 290,973 polimorfismos de nucleótido único (SNPs)) con diferencias correspondientes en rasgos relacionados con la floración en dos ubicaciones en el sur de Brasil. Además, se aplicó la priorización de genes asistida por redes (NAGP) para comprender mejor la base genética de los rasgos relacionados con la floración en el maíz tropical. Según los resultados, el desequilibrio de ligamiento (LD) disminuyó rápidamente en 3 kb, con un valor de corte de r = 0.11. Se identificaron valores totales de 45 y 44 asociaciones marcador-rasgo (SNPs y HBs, respectivamente). Otro hallazgo importante fue la identificación de HBs que explican más del 10% de la variación total. NAGP identificó 44, 22 y 34 genes relacionados con el tiempo de floración femenina/masculina y el intervalo de antesis-silking, respectivamente. El enfoque de red co-funcional identificó cuatro genes directamente relacionados con el tiempo de floración femenina (<0.0001): , , , y . NAGP proporcionó nuevas ideas sobre la arquitectura genética y los mecanismos subyacentes de los rasgos relacionados con la floración en el maíz tropical.