es una fuente de un nuevo antibiótico, rhodomyrtone. Debido a la creciente demanda industrial de este compuesto, el germoplasma con un alto contenido de rhodomyrtone es clave para un cultivo sostenible en el futuro. En este estudio, se verificaron los genotipos de rhodomyrtone utilizando el marcador de la región genómica plastidial y el espaciador interno transcrito nuclear ITS. Estos dos códigos de barras de ADN demostraron ser herramientas útiles para identificar diferentes contenidos de rhodomyrtone a través de los haplotipos SNP C569T y A561G, respectivamente. Los resultados se correlacionaron con el contenido de rhodomyrtone determinado mediante HPLC. Posteriormente, se recolectaron muestras con genotipos de alto y bajo contenido de rhodomyrtone para análisis de transcriptoma de novo y expresión génica. Un total de 83,402 unigenes fueron clasificados en 25 clasificaciones KOG, y se obtuvieron 74,102 unigenes anotados. El análisis de expresión génica diferencial entre muestras o grupos utilizando DESeq2 reveló niveles altamente expresados relacionados con el contenido de rhodomyrtone en dos genotipos. La RT-PCR semicuantitativa reveló además que el alto contenido de rhodomyrtone en estos dos genotipos se correlacionó con la expresión de la proteína transportadora de zinc. Además, encontramos que la expresión resultó en una mayor sensibilidad bajo estrés de ZnSO. Los hallazgos proporcionan información útil para la selección de sitios de cultivo para lograr altos rendimientos de rhodomyrtone.