Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de respuesta a hormonas exógenas y estrés del gen en la familia de soja ()
Autores: Cai, Lijun; Guo, Zhenhua; Ding, Junjie; Gai, Zhijia; Liu, Jingqi; Meng, Qingying; Yang, Xu; Zhang, Na; Wang, Qingsheng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de respuesta a hormonas exógenas y estrés del gen en la familia de soja ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Familia de factores de transcripción
Familia de genes
Clasificación filogenética
Duplicación génica
Elementos cis-reguladores
Respuestas hormonales
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 32
Citaciones: Sin citaciones
La familia de factores de transcripción GARP es fundamental para la regulación del crecimiento de las plantas, el desarrollo, las vías de señalización hormonal, los ritmos circadianos y las respuestas tanto a factores bióticos como abióticos. A pesar de su importancia reconocida, una caracterización integral de la familia de genes en sigue sin explorarse. En este estudio, identificamos 126 genes en los 16 cromosomas de y elucidamos sus diversas propiedades fisicoquímicas. La clasificación filogenética agrupó los genes en ocho subfamilias distintas, basadas en motivos conservados y estructuras génicas, lo que sugiere una conservación funcional y evolutiva dentro de estos grupos. El descubrimiento de 56 pares de genes duplicados segmentariamente destaca la duplicación génica como un impulsor clave de la expansión de la familia. El análisis del promotor reveló varios elementos cis-regulatorios, mientras que el perfil de expresión demostró que los genes poseen una especificidad tisular significativa. Además, el análisis de qRT-PCR indicó que los genes son altamente sensibles a hormonas exógenas, como ABA, MeJA y GA, así como a estresores abióticos, incluyendo frío, sal y condiciones de sequía. Especialmente, y contienen elementos cis específicos vinculados a respuestas hormonales, cuya interacción fue verificada a través de ensayos de levadura de dos híbridos (Y2H) y complementación de fluorescencia bimolecular (BiFC). Adicionalmente, se predijeron 11,195 genes blanco potenciales, subrayando el potencial regulatorio de los factores de transcripción GmGARP. Estos hallazgos proporcionan ideas significativas sobre la familia de genes, sentando una sólida base para futuros estudios sobre su papel en el desarrollo y las respuestas adaptativas a factores de estrés ambiental.
Descripción
La familia de factores de transcripción GARP es fundamental para la regulación del crecimiento de las plantas, el desarrollo, las vías de señalización hormonal, los ritmos circadianos y las respuestas tanto a factores bióticos como abióticos. A pesar de su importancia reconocida, una caracterización integral de la familia de genes en sigue sin explorarse. En este estudio, identificamos 126 genes en los 16 cromosomas de y elucidamos sus diversas propiedades fisicoquímicas. La clasificación filogenética agrupó los genes en ocho subfamilias distintas, basadas en motivos conservados y estructuras génicas, lo que sugiere una conservación funcional y evolutiva dentro de estos grupos. El descubrimiento de 56 pares de genes duplicados segmentariamente destaca la duplicación génica como un impulsor clave de la expansión de la familia. El análisis del promotor reveló varios elementos cis-regulatorios, mientras que el perfil de expresión demostró que los genes poseen una especificidad tisular significativa. Además, el análisis de qRT-PCR indicó que los genes son altamente sensibles a hormonas exógenas, como ABA, MeJA y GA, así como a estresores abióticos, incluyendo frío, sal y condiciones de sequía. Especialmente, y contienen elementos cis específicos vinculados a respuestas hormonales, cuya interacción fue verificada a través de ensayos de levadura de dos híbridos (Y2H) y complementación de fluorescencia bimolecular (BiFC). Adicionalmente, se predijeron 11,195 genes blanco potenciales, subrayando el potencial regulatorio de los factores de transcripción GmGARP. Estos hallazgos proporcionan ideas significativas sobre la familia de genes, sentando una sólida base para futuros estudios sobre su papel en el desarrollo y las respuestas adaptativas a factores de estrés ambiental.