Las proteínas del motivo tripartito (TRIMs), especialmente los TRIMs que contienen el dominio B30.2 (TRIMs-B30.2), son cada vez más conocidas por sus funciones inmunitarias antivirales en mamíferos, mientras que los TRIMs antivirales están lejos de ser identificados en teleósteos. En el presente estudio, identificamos un total de 42 TRIMs del genoma de la carpa herbívora, un importante teleósteo cultivado en China, basado en el análisis de hmmsearch y SMART. Entre estos TRIMs, los loci génicos de 37 TRIMs se localizaron en diferentes cromosomas y compartieron colinealidades génicas con contrapartes homólogas de los genomas humano y de pez cebra. Poseían ensamblajes conservados intactos de dominios RBCC o RB en sus extremos N y ocho dominios diferentes, incluido el dominio B30.2, en sus extremos C. Se identificaron un total de 19 TRIMs-B30.2, y la mayoría de ellos se agruparon en una gran rama de TRIMs en el dendrograma. El análisis de expresión tisular mostró que los 42 TRIMs se expresaron universalmente en varios tejidos de la carpa herbívora. Se encontraron un total de 11 TRIMs expresados diferencialmente significativos en dos conjuntos de transcriptomas de carpa herbívora durante la infección por el reovirus de carpa herbívora (GCRV). Tres de ellos, incluidos btr40, TRIM103 y TRIM109, que todos pertenecían a TRIMs-B30.2, estaban asociados con la respuesta de interferón tipo I durante la infección por GCRV mediante análisis de coexpresión de red ponderada y análisis de tendencias de expresión génica, sugiriendo su participación en la inmunidad antiviral. Estos hallazgos pueden ofrecer información útil para comprender la estructura, evolución y función de los TRIMs en teleósteos y proporcionar posibles marcadores de moléculas inmunitarias antivirales para la carpa herbívora.