Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de la familia de genes PHD Finger en guisante ()
Autores: Liu, Mingli; Li, Wenju; Zheng, Xiaoling; Yuan, Zhuo; Zhou, Yueqiong; Yang, Jing; Mao, Yawen; Wang, Dongfa; Wu, Qing; He, Yexin; He, Liangliang; Zong, Dan; Chen, Jianghua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de la familia de genes PHD Finger en guisante ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Dedo homeodominio de planta
Proteína de dedo de zinc
Eucariotas
Guisante
Análisis de árbol filogenético
Dominios conservados
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
La proteína del dedo homeodominio PHD (dedo PHD), un tipo de proteína de dedo de zinc ampliamente distribuida en eucariotas, desempeña diversos roles en la regulación del crecimiento y desarrollo de las plantas. Aunque se han identificado proteínas de dedo PHD en varias especies, sus funciones siguen siendo en gran medida inexploradas en el guisante. En este estudio, identificamos 84 miembros de la familia de genes del dedo PHD en el guisante, que mostraron una distribución desigual en siete cromosomas. A través de un análisis exhaustivo utilizando datos de y, categorizamos las proteínas de dedo PHD en 20 subfamilias mediante un análisis de árbol filogenético. Cada subfamilia exhibió variaciones distintas en términos de cantidad, estructura genética, dominios conservados y propiedades físicas y químicas. El análisis de colinealidad reveló relaciones evolutivas conservadas entre los genes del dedo PHD en las tres especies diferentes. Además, identificamos los roles conservados e importantes de los miembros de la subfamilia M en el desarrollo de los anteras. RT-qPCR e hibridación in situ revelaron una alta expresión de los miembros de la subfamilia M del guisante en microsporas y en la capa de tapetum. En conclusión, este análisis de la familia del dedo PHD en el guisante proporciona una valiosa guía para futuras investigaciones sobre los roles biológicos de las proteínas del dedo PHD en el guisante y otras plantas leguminosas.
Descripción
La proteína del dedo homeodominio PHD (dedo PHD), un tipo de proteína de dedo de zinc ampliamente distribuida en eucariotas, desempeña diversos roles en la regulación del crecimiento y desarrollo de las plantas. Aunque se han identificado proteínas de dedo PHD en varias especies, sus funciones siguen siendo en gran medida inexploradas en el guisante. En este estudio, identificamos 84 miembros de la familia de genes del dedo PHD en el guisante, que mostraron una distribución desigual en siete cromosomas. A través de un análisis exhaustivo utilizando datos de y, categorizamos las proteínas de dedo PHD en 20 subfamilias mediante un análisis de árbol filogenético. Cada subfamilia exhibió variaciones distintas en términos de cantidad, estructura genética, dominios conservados y propiedades físicas y químicas. El análisis de colinealidad reveló relaciones evolutivas conservadas entre los genes del dedo PHD en las tres especies diferentes. Además, identificamos los roles conservados e importantes de los miembros de la subfamilia M en el desarrollo de los anteras. RT-qPCR e hibridación in situ revelaron una alta expresión de los miembros de la subfamilia M del guisante en microsporas y en la capa de tapetum. En conclusión, este análisis de la familia del dedo PHD en el guisante proporciona una valiosa guía para futuras investigaciones sobre los roles biológicos de las proteínas del dedo PHD en el guisante y otras plantas leguminosas.