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Identificación a nivel del genoma y análisis de la expresión de la familia de genes GATA bajo diferentes niveles de nitrógeno en L

Autores: Li, Xiujie; Deng, Xiaoxu; Han, Suoyi; Zhang, Xinyou; Dai, Tingbo

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación a nivel del genoma y análisis de la expresión de la familia de genes GATA bajo diferentes niveles de nitrógeno en L


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Nitrógeno
Crecimiento del maní
Factores de transcripción de dedo de zinc GATA
Familia de genes
Niveles de nitrógeno
Expresión génica

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 27

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El nitrógeno, uno de los elementos esenciales, es un determinante clave para mejorar el crecimiento y rendimiento del cacahuete. Los factores de transcripción de dedos de zinc GATA se han encontrado que están involucrados en la regulación del metabolismo del nitrógeno. Sin embargo, una caracterización sistemática de la familia de genes GATA y los patrones de su expresión bajo diferentes niveles de nitrógeno sigue siendo esquiva. En este estudio, se identificaron un total de 45 genes GATA distribuidos en 17 cromosomas en el genoma del cacahuete y se clasificaron en tres subfamilias I, II y III con 26, 13 y 6 miembros, respectivamente, cuyas características fisicoquímicas, estructuras génicas y motivos conservados también fueron analizados. Además, el nivel óptimo de fertilizante de nitrógeno en el crecimiento del cultivar de cacahuete Yuhua 23 fue determinado por el rendimiento de vainas y la relación de costo-valor de 2020 a 2022, y los resultados revelaron que 150 kg hm de nitrógeno fue el mejor para el cultivo de cacahuete Yuhua 23 debido a su mayor rendimiento de vainas y un VCR relativamente más alto de más de cuatro. Además, los patrones de expresión de los genes GATA de cacahuete bajo diferentes niveles de nitrógeno fueron detectados por PCR cuantitativa en tiempo real y varios genes GATA cambiaron significativamente bajo un nivel de nitrógeno de 150 kg hm. En general, los resultados anteriores serían útiles para comprender mejor las funciones biológicas de la familia de genes GATA en el cacahuete cultivado.

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