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Caracterización a Nivel del Genoma de Genes de la Familia y Análisis de Expresión en Respuesta al Estrés Osmótico en

Autores: Zhao, Leifei; Bi, Weiyi; Jia, Yaqi; Shi, Jingjing; Chi, Yao; Yu, Mingyu; Wang, Chao

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Caracterización a Nivel del Genoma de Genes de la Familia y Análisis de Expresión en Respuesta al Estrés Osmótico en


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Factores de transcripción
Plantas
Crecimiento
Estrés
Genes
Estrés por sequía

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 12

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La familia bHLH, como una superfamilia de factores de transcripción (TFs), tiene características funcionales especiales en las plantas y desempeña un papel crucial en el crecimiento y desarrollo de la planta, así como en ayudar a la planta a hacer frente a diversas tensiones. En este estudio, se seleccionaron 128 genes de la familia en el genoma del abedul utilizando análisis de escaneo de dominios conservados y blast. Estos genes se agrupan en 21 subfamilias según la construcción del árbol filogenético y están distribuidos de manera desigual entre los 14 cromosomas del abedul. En total, se identificaron 22 pares de duplicación segmental con 27 genes. Las duplicaciones se distribuyeron en ocho cromosomas. El análisis de las estructuras génicas y los motivos proteicos reveló la conservación intra-grupo de los BpbHLHs. De los genes de la familia, 16 contienen solo un intrón cada uno. El gen que contiene más intrones tiene 19. Se encontraron elementos cis, que responden a hormonas vegetales, luz, defensa y estrés, en el promotor de los genes de la familia. Según el análisis de datos de RNA-seq, bajo estrés osmótico de PEG, la mayoría de los genes se expresaron diferencialmente, y ocho se expresaron de manera altamente diferencial. Los resultados del análisis de qRT-PCR indicaron además que fue el gen con el nivel de expresión más alto en hojas, raíces y tallos, y que la expresión de estos ocho genes fue mayor en hojas que en raíces y tallos, y se reguló al alza en los tres tejidos bajo estrés osmótico en comparación con los controles. El análisis anterior sugiere que los genes de la familia tienen un cierto efecto biológico bajo estrés por sequía, lo que proporciona una base para la cría molecular para la resistencia al estrés en el abedul.

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