Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de la familia de genes TIR-NBS-LRR y su respuesta a enfermedades fúngicas en la rosa ()
Autores: Song, Jurong; Chen, Feng; Lv, Bo; Guo, Cong; Yang, Jie; Huang, Li; Guo, Jiaqi; Xiang, Fayun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de la familia de genes TIR-NBS-LRR y su respuesta a enfermedades fúngicas en la rosa ()
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Rosas
Patógenos
Genes TNL
Respuestas de defensa
Familia de genes
Resistencia a enfermedades
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
Las rosas, que son una de las plantas ornamentales más importantes del mundo, a menudo son dañadas por patógenos, lo que resulta en pérdidas económicas graves. Como una subclase de la familia de genes de resistencia a enfermedades de los receptores similares a dominios de unión a nucleótidos (NOD) de plantas, los genes TIR-NBS-LRR (TNL) juegan un papel vital en la identificación de efectores de patógenos y en la activación de respuestas de defensa. Sin embargo, rara vez se informa de un análisis sistemático de la familia de genes TNL en rosas. En este estudio, se identificaron 96 genes TNL intactos. Se analizaron sus filogenias, características fisicoquímicas, estructuras génicas, dominios y motivos conservados, elementos cis-promotores, sitios de unión de microARN y relaciones de colinealidad intra e inter-específica. Un análisis de expresión utilizando datos de transcriptoma reveló que los genes se expresaron predominantemente en las hojas. Algunos genes respondieron a giberelina, ácido jasmónico, ácido salicílico y (); el gen respondió significativamente a tres hormonas y tres patógenos, y mostró una expresión regulada al alza. Además, se identificó al patógeno de la mancha negra como . Después de inocular las hojas de rosa, un análisis del patrón de expresión de los genes sugirió que actúan durante diferentes períodos de infección por patógenos. El presente estudio sienta las bases para una investigación en profundidad de la función del gen TNL y la búsqueda de genes de resistencia a enfermedades en rosas.
Descripción
Las rosas, que son una de las plantas ornamentales más importantes del mundo, a menudo son dañadas por patógenos, lo que resulta en pérdidas económicas graves. Como una subclase de la familia de genes de resistencia a enfermedades de los receptores similares a dominios de unión a nucleótidos (NOD) de plantas, los genes TIR-NBS-LRR (TNL) juegan un papel vital en la identificación de efectores de patógenos y en la activación de respuestas de defensa. Sin embargo, rara vez se informa de un análisis sistemático de la familia de genes TNL en rosas. En este estudio, se identificaron 96 genes TNL intactos. Se analizaron sus filogenias, características fisicoquímicas, estructuras génicas, dominios y motivos conservados, elementos cis-promotores, sitios de unión de microARN y relaciones de colinealidad intra e inter-específica. Un análisis de expresión utilizando datos de transcriptoma reveló que los genes se expresaron predominantemente en las hojas. Algunos genes respondieron a giberelina, ácido jasmónico, ácido salicílico y (); el gen respondió significativamente a tres hormonas y tres patógenos, y mostró una expresión regulada al alza. Además, se identificó al patógeno de la mancha negra como . Después de inocular las hojas de rosa, un análisis del patrón de expresión de los genes sugirió que actúan durante diferentes períodos de infección por patógenos. El presente estudio sienta las bases para una investigación en profundidad de la función del gen TNL y la búsqueda de genes de resistencia a enfermedades en rosas.