Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión In Silico de la Familia de Genes en (Cítricos) en Respuesta al Estrés Abiótico
Autores: Sarwar, Sadaf; Sami, Adnan; Haider, Muhammad Zeshan; Tasawar, Layba; Akram, Jannat; Ahmad, Arsalan; Shafiq, Muhammad; Zaki, Haitham E. M.; Ondrasek, Gabrijel; Shahid, Muhammad Shafiq
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión In Silico de la Familia de Genes en (Cítricos) en Respuesta al Estrés Abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Fitohormonas
Genes
ácido abscísico
Pigmento
Estrigolactona
Genoma
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La planta (cítrica) produce varios fitohormonas debido a la significativa participación de la familia de genes de la carotenoide cleavasa oxigenasa en su crecimiento y desarrollo. Los genes se pueden dividir en dos categorías principales: la dioxygenasa de carotenoides 9-cis-epóxido, responsable de la producción de ácido abscísico (ABA), y la dioxygenasa de cleavasa de carotenoides, involucrada en la formación de pigmentos y estrigolactonas. Para comprender mejor los roles y posiciones de los miembros de los genes en relación con estas hormonas, los investigadores analizaron el genoma de la clementina. Para identificar sus características estructurales, emplearon análisis filogenético, interacciones proteicas, localización, estructura, objetivos de miARN, análisis evolutivo y estudios de transcriptoma. El estudio reveló la presencia de 15 genes, incluidos 11 y 4 genes, dispersos en varios cromosomas, con la mayoría ubicados en cloroplastos. El análisis de secuenciación de promotores indicó la presencia de diferentes elementos cis-regulatorios que probablemente interactuaron con fitohormonas, como auxina y ácido abscísico, entre otros. Notablemente, dos genes fueron expresados significativamente entre los genes, y se encontraron expresados durante el estrés y desempeñaron un papel crucial en permitir un desarrollo óptimo de la planta. Además, se realizó una comparación exhaustiva a nivel genómico de los genes en modelos para comprender sus características funcionales. Esta investigación proporciona una base sólida para una exploración más profunda de los atributos únicos de la planta, contribuyendo a una comprensión más profunda de sus procesos de crecimiento y desarrollo.
Descripción
La planta (cítrica) produce varios fitohormonas debido a la significativa participación de la familia de genes de la carotenoide cleavasa oxigenasa en su crecimiento y desarrollo. Los genes se pueden dividir en dos categorías principales: la dioxygenasa de carotenoides 9-cis-epóxido, responsable de la producción de ácido abscísico (ABA), y la dioxygenasa de cleavasa de carotenoides, involucrada en la formación de pigmentos y estrigolactonas. Para comprender mejor los roles y posiciones de los miembros de los genes en relación con estas hormonas, los investigadores analizaron el genoma de la clementina. Para identificar sus características estructurales, emplearon análisis filogenético, interacciones proteicas, localización, estructura, objetivos de miARN, análisis evolutivo y estudios de transcriptoma. El estudio reveló la presencia de 15 genes, incluidos 11 y 4 genes, dispersos en varios cromosomas, con la mayoría ubicados en cloroplastos. El análisis de secuenciación de promotores indicó la presencia de diferentes elementos cis-regulatorios que probablemente interactuaron con fitohormonas, como auxina y ácido abscísico, entre otros. Notablemente, dos genes fueron expresados significativamente entre los genes, y se encontraron expresados durante el estrés y desempeñaron un papel crucial en permitir un desarrollo óptimo de la planta. Además, se realizó una comparación exhaustiva a nivel genómico de los genes en modelos para comprender sus características funcionales. Esta investigación proporciona una base sólida para una exploración más profunda de los atributos únicos de la planta, contribuyendo a una comprensión más profunda de sus procesos de crecimiento y desarrollo.