Identificación a nivel genómico y análisis de la expresión en respuesta al estrés salino de la familia de genes en soja (L.)
Autores: Wang, Mingyu; Guan, Zheyun; Wu, Songquan; Zhang, Jingyong; Lin, Chunjing; Sun, Yanyan; Shen, Mingzhe; Zhang, Chunbao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación a nivel genómico y análisis de la expresión en respuesta al estrés salino de la familia de genes en soja (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Sojas
Estrés salino
Familia de genes
Perfilado de expresión
Tolerancia al estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción específicos de las plantas desempeñan roles cruciales en el crecimiento, desarrollo y respuestas a estrés abiótico en las plantas. Sin embargo, a pesar de su importancia funcional, los genes siguen estando poco caracterizados en la soja. En este estudio, realizamos un análisis a nivel genómico de la familia de genes e investigamos sus perfiles de expresión bajo estrés salino. Identificamos un total de 29 genes en el genoma de la soja y analizamos sistemáticamente sus propiedades fisicoquímicas, dominios conservados, relaciones evolutivas, elementos cis-actuantes y patrones de regulación de expresión. Las predicciones de localización subcelular indicaron localización nuclear para la mayoría, excepto para algunos, que mostraron localización dual en cloroplastos y núcleo. Un análisis de expansión de la familia de genes indicó que 21 eventos de duplicación segmental fueron el principal motor de diversificación. Un análisis filogenético clasificó los genes en cuatro subgrupos, mientras que los análisis de estructura de genes y motivos revelaron dominios de unión al zinc conservados e identificaron múltiples elementos cis-actuantes asociados con la respuesta a la luz, señalización hormonal y respuestas al estrés. El perfil de expresión mostró patrones de expresión específicos de tejido, con 13 genes expresados diferencialmente bajo estrés salino, incluidos miembros preferenciales de raíz y miembros preferenciales de hoja. Este estudio proporciona una base teórica para una investigación más profunda de las funciones de los genes en el desarrollo de la soja y la tolerancia al estrés.
Descripción
Los factores de transcripción específicos de las plantas desempeñan roles cruciales en el crecimiento, desarrollo y respuestas a estrés abiótico en las plantas. Sin embargo, a pesar de su importancia funcional, los genes siguen estando poco caracterizados en la soja. En este estudio, realizamos un análisis a nivel genómico de la familia de genes e investigamos sus perfiles de expresión bajo estrés salino. Identificamos un total de 29 genes en el genoma de la soja y analizamos sistemáticamente sus propiedades fisicoquímicas, dominios conservados, relaciones evolutivas, elementos cis-actuantes y patrones de regulación de expresión. Las predicciones de localización subcelular indicaron localización nuclear para la mayoría, excepto para algunos, que mostraron localización dual en cloroplastos y núcleo. Un análisis de expansión de la familia de genes indicó que 21 eventos de duplicación segmental fueron el principal motor de diversificación. Un análisis filogenético clasificó los genes en cuatro subgrupos, mientras que los análisis de estructura de genes y motivos revelaron dominios de unión al zinc conservados e identificaron múltiples elementos cis-actuantes asociados con la respuesta a la luz, señalización hormonal y respuestas al estrés. El perfil de expresión mostró patrones de expresión específicos de tejido, con 13 genes expresados diferencialmente bajo estrés salino, incluidos miembros preferenciales de raíz y miembros preferenciales de hoja. Este estudio proporciona una base teórica para una investigación más profunda de las funciones de los genes en el desarrollo de la soja y la tolerancia al estrés.