Análisis bioinformático a nivel genómico de la familia de genes y verificación de la expresión de genes candidatos en
Autores: Iqbal, Javed; Zhang, Wuhua; Fan, Yingdong; Dong, Jie; Xie, Yangyang; Li, Ronghui; Yang, Tao; Zhang, Jinzhu; Che, Daidi
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis bioinformático a nivel genómico de la familia de genes y verificación de la expresión de genes candidatos en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Azúcares
Genes
Genoma
Análisis filogenético
Expresión génica
Formación de tubérculos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los azúcares actúan como las principales fuentes de energía en muchos cultivos de frutas y verduras. La biosíntesis y el transporte de azúcares son cruciales y contribuyen especialmente al crecimiento y desarrollo. es una familia de genes importante que desempeña un papel vital en el crecimiento, desarrollo y adaptación de las plantas a varios tipos de estrés (biótico y abiótico). Aunque se han identificado genes en numerosas especies de plantas, no hay información sobre en . En el presente estudio, realizamos un análisis bioinformático integral a nivel genómico y identificamos un total de 23 genes candidatos en el genoma, que estaban distribuidos aleatoriamente en diez cromosomas diferentes. El análisis filogenético, la ubicación cromosómica, la estructura del gen, los elementos cis específicos, la red de interacción de proteínas y las características fisiológicas de estos genes fueron examinados sistemáticamente. Los resultados identificados de la relación filogenética con revelaron que estos genes se dividieron en cuatro clados (I, II, III y IV). Además, la expresión génica específica de tejidos a través de la validación por reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) expuso que los identificados se expresaron diferencialmente en varios tejidos (raíces, tallos, hojas y flores). Principalmente, la expresión relativa del gen en tubérculos hinchados y no hinchados reveló efectivamente que (7, 9 y 12) se expresaron altamente (300-, 120- y 100-veces) en tubérculos hinchados. Para esclarecer aún más la función de (7, 9 y 12), se confirmó su localización subcelular al insertarlos en hojas de tabaco, y se observó que estos genes estaban presentes en la membrana celular. Con base en los resultados generales, se sugiere que (7, 9 y 12) son los genes candidatos involucrados en la formación de tubérculos hinchados en . En resumen, especulamos que nuestro estudio proporciona una base teórica valiosa para un análisis funcional más profundo de la familia de genes y su papel en el desarrollo de tubérculos, además de mejorar la cría molecular de.
Descripción
Los azúcares actúan como las principales fuentes de energía en muchos cultivos de frutas y verduras. La biosíntesis y el transporte de azúcares son cruciales y contribuyen especialmente al crecimiento y desarrollo. es una familia de genes importante que desempeña un papel vital en el crecimiento, desarrollo y adaptación de las plantas a varios tipos de estrés (biótico y abiótico). Aunque se han identificado genes en numerosas especies de plantas, no hay información sobre en . En el presente estudio, realizamos un análisis bioinformático integral a nivel genómico y identificamos un total de 23 genes candidatos en el genoma, que estaban distribuidos aleatoriamente en diez cromosomas diferentes. El análisis filogenético, la ubicación cromosómica, la estructura del gen, los elementos cis específicos, la red de interacción de proteínas y las características fisiológicas de estos genes fueron examinados sistemáticamente. Los resultados identificados de la relación filogenética con revelaron que estos genes se dividieron en cuatro clados (I, II, III y IV). Además, la expresión génica específica de tejidos a través de la validación por reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) expuso que los identificados se expresaron diferencialmente en varios tejidos (raíces, tallos, hojas y flores). Principalmente, la expresión relativa del gen en tubérculos hinchados y no hinchados reveló efectivamente que (7, 9 y 12) se expresaron altamente (300-, 120- y 100-veces) en tubérculos hinchados. Para esclarecer aún más la función de (7, 9 y 12), se confirmó su localización subcelular al insertarlos en hojas de tabaco, y se observó que estos genes estaban presentes en la membrana celular. Con base en los resultados generales, se sugiere que (7, 9 y 12) son los genes candidatos involucrados en la formación de tubérculos hinchados en . En resumen, especulamos que nuestro estudio proporciona una base teórica valiosa para un análisis funcional más profundo de la familia de genes y su papel en el desarrollo de tubérculos, además de mejorar la cría molecular de.