Identificación a Nivel Genómico y Análisis Evolutivo de la Familia de Genes Relacionados con m6A en Álamo Nanlin895
Autores: Li, Zeyu; Liu, Rongxia; Zhu, Mingqiang; Zhang, Jinye; Li, Zhoujin; Huang, Kaixin; Ren, Zehua; Zhao, Yan; Luo, Keming; Song, Qin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación a Nivel Genómico y Análisis Evolutivo de la Familia de Genes Relacionados con m6A en Álamo Nanlin895
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
M6a
Rna
Modificación
Genes
Crecimiento
Estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
N6-metiladenosina (m6A) es la modificación química más prevalente del ARN eucariota, desempeñando un papel crucial en la regulación del crecimiento y desarrollo de las plantas, las respuestas al estrés y otros procesos biológicos esenciales. Las enzimas involucradas en la modificación de m6A: metiltransferasas (escritores), desmetilasas (borradores) y proteínas de reconocimiento (lectores) han sido identificadas en varias especies de plantas; sin embargo, sus roles en la especie arbórea económicamente significativa x (NL895) siguen siendo poco explorados. En este estudio, identificamos 39 genes relacionados con m6A en el genoma de NL895, que comprenden 8 escritores, 13 borradores y 18 lectores. El análisis evolutivo indicó que la expansión de escritores y lectores resultó principalmente de eventos de duplicación del genoma completo. Se observaron presiones de selección purificadora en todos los pares de genes duplicados, lo que sugiere sus roles esenciales en la diferenciación funcional. El análisis filogenético reveló que los escritores, borradores y lectores se clasifican en seis, cuatro y dos grupos, respectivamente, siendo estos genes más conservados entre las plantas dicotiledóneas. La estructura del gen, los dominios de proteínas y los motivos mostraron una mayor conservación dentro del mismo grupo. El análisis del promotor de los genes relacionados con m6A mostró un enriquecimiento de elementos de acción asociados con respuestas a la luz, fitohormonas y estrés, indicando su posible participación en la regulación de la expresión génica. Bajo tratamiento con cadmio, la expresión de todos los escritores se reguló significativamente al alza en los tejidos aéreos y radiculares de NL895. Este estudio identificó sistemáticamente las familias de genes relacionadas con m6A en x (NL895), elucidando sus patrones evolutivos y características de regulación de expresión. Estos hallazgos proporcionan una base teórica para analizar los mecanismos moleculares de la modificación de m6A en el crecimiento, desarrollo y adaptación al estrés del álamo, y ofrecieron genes candidatos para la mejora molecular en árboles forestales.
Descripción
N6-metiladenosina (m6A) es la modificación química más prevalente del ARN eucariota, desempeñando un papel crucial en la regulación del crecimiento y desarrollo de las plantas, las respuestas al estrés y otros procesos biológicos esenciales. Las enzimas involucradas en la modificación de m6A: metiltransferasas (escritores), desmetilasas (borradores) y proteínas de reconocimiento (lectores) han sido identificadas en varias especies de plantas; sin embargo, sus roles en la especie arbórea económicamente significativa x (NL895) siguen siendo poco explorados. En este estudio, identificamos 39 genes relacionados con m6A en el genoma de NL895, que comprenden 8 escritores, 13 borradores y 18 lectores. El análisis evolutivo indicó que la expansión de escritores y lectores resultó principalmente de eventos de duplicación del genoma completo. Se observaron presiones de selección purificadora en todos los pares de genes duplicados, lo que sugiere sus roles esenciales en la diferenciación funcional. El análisis filogenético reveló que los escritores, borradores y lectores se clasifican en seis, cuatro y dos grupos, respectivamente, siendo estos genes más conservados entre las plantas dicotiledóneas. La estructura del gen, los dominios de proteínas y los motivos mostraron una mayor conservación dentro del mismo grupo. El análisis del promotor de los genes relacionados con m6A mostró un enriquecimiento de elementos de acción asociados con respuestas a la luz, fitohormonas y estrés, indicando su posible participación en la regulación de la expresión génica. Bajo tratamiento con cadmio, la expresión de todos los escritores se reguló significativamente al alza en los tejidos aéreos y radiculares de NL895. Este estudio identificó sistemáticamente las familias de genes relacionadas con m6A en x (NL895), elucidando sus patrones evolutivos y características de regulación de expresión. Estos hallazgos proporcionan una base teórica para analizar los mecanismos moleculares de la modificación de m6A en el crecimiento, desarrollo y adaptación al estrés del álamo, y ofrecieron genes candidatos para la mejora molecular en árboles forestales.