Análisis Genómico Integral de en Rosaceae y Análisis de Expresión de en Respuesta al Estrés Abiótico en
Autores: Wang, Guoming; Guan, Sophia Lee; Zhu, Nan; Li, Qionghou; Chong, Xinran; Wang, Tao; Xuan, Jiping
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis Genómico Integral de en Rosaceae y Análisis de Expresión de en Respuesta al Estrés Abiótico en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Sacarosa no fermentadora
Quinasa de proteínas
Estrés abiótico
Especies de Rosaceae
Expansión de la familia de genes
Mecanismos moleculares
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La quinasa relacionada con la proteína no fermentadora de sacarosa 1 (SnRK) desempeña un papel importante en la respuesta a estrés abiótico al fosforilar la proteína objetivo para regular diversas vías de señalización. Sin embargo, se conoce poco sobre las características, la historia evolutiva y los patrones de expresión de la familia en la frambuesa negra (L.) u otras especies de la familia Rosaceae. En este estudio, se identificaron un total de 209 genes en 7 especies de Rosaceae y se dividieron en 3 subfamilias (y) basándose en el análisis filogenético y motivos específicos. La duplicación del genoma completo (WGD) y la duplicación dispersa (DSD) se consideraron contribuciones importantes a la expansión de la familia. La selección purificadora fue la fuerza impulsora principal en la evolución de la familia. La expresión espacial indicó que los genes pueden desempeñar roles importantes en diferentes tejidos. Además, se detectaron los modelos de expresión de 5 genes en respuesta a estrés abiótico mediante qRT-PCR. Las proteínas codificadas por los genes se localizan en el citoplasma y el núcleo para realizar sus respectivas funciones. En conjunto, este estudio proporcionó un análisis de la expansión y evolución de la familia de genes, y contribuyó al conocimiento actual de la función de 5 genes, lo que a su vez amplió la comprensión de los mecanismos moleculares de las respuestas de la frambuesa negra al estrés abiótico.
Descripción
La quinasa relacionada con la proteína no fermentadora de sacarosa 1 (SnRK) desempeña un papel importante en la respuesta a estrés abiótico al fosforilar la proteína objetivo para regular diversas vías de señalización. Sin embargo, se conoce poco sobre las características, la historia evolutiva y los patrones de expresión de la familia en la frambuesa negra (L.) u otras especies de la familia Rosaceae. En este estudio, se identificaron un total de 209 genes en 7 especies de Rosaceae y se dividieron en 3 subfamilias (y) basándose en el análisis filogenético y motivos específicos. La duplicación del genoma completo (WGD) y la duplicación dispersa (DSD) se consideraron contribuciones importantes a la expansión de la familia. La selección purificadora fue la fuerza impulsora principal en la evolución de la familia. La expresión espacial indicó que los genes pueden desempeñar roles importantes en diferentes tejidos. Además, se detectaron los modelos de expresión de 5 genes en respuesta a estrés abiótico mediante qRT-PCR. Las proteínas codificadas por los genes se localizan en el citoplasma y el núcleo para realizar sus respectivas funciones. En conjunto, este estudio proporcionó un análisis de la expansión y evolución de la familia de genes, y contribuyó al conocimiento actual de la función de 5 genes, lo que a su vez amplió la comprensión de los mecanismos moleculares de las respuestas de la frambuesa negra al estrés abiótico.