Un análisis a nivel del genoma y perfil de expresión de la familia de genes del factor de transcripción de choque térmico (Hsf) en
Autores: Xu, Yanan; Jin, Ying; He, Dan; Di, Haochen; Liang, Ying; Xu, Yanxia
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Un análisis a nivel del genoma y perfil de expresión de la familia de genes del factor de transcripción de choque térmico (Hsf) en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción de choque térmico
Vías regulatorias transcripcionales
Relaciones filogenéticas
Elementos cis-actuantes
De manera específica de tejido
Variedades tolerantes al estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción de choque térmico son actores clave en una serie de vías regulatorias de transcripción que funcionan durante el crecimiento y desarrollo de las plantas. Sin embargo, su modo de acción aún no está claro. En este estudio, se identificaron 22 genes a partir de datos genómicos. Los 22 genes se distribuyeron aleatoriamente en 12 cromosomas y se dividieron en tres grupos principales según sus relaciones filogenéticas. Se predijeron las estructuras y motivos conservados para los 22 genes. El análisis de elementos cis-actuantes reveló elementos responsivos al estrés y a fitohormonas en las regiones promotoras de los genes, pero los tipos y números variaron entre los diferentes grupos de genes. Los análisis de perfiles de transcripción revelaron que se expresaron de manera específica en los tejidos, con niveles de transcripción particularmente altos en las raíces. Los perfiles de transcripción bajo estrés abiótico se detectaron mediante qRT-PCR, y los resultados validaron aún más la función crítica de estos genes. Este estudio proporciona información básica sobre la familia RsHsf y allana el camino para futuras investigaciones que aclaren sus roles precisos y para criar nuevas variedades tolerantes al estrés.
Descripción
Los factores de transcripción de choque térmico son actores clave en una serie de vías regulatorias de transcripción que funcionan durante el crecimiento y desarrollo de las plantas. Sin embargo, su modo de acción aún no está claro. En este estudio, se identificaron 22 genes a partir de datos genómicos. Los 22 genes se distribuyeron aleatoriamente en 12 cromosomas y se dividieron en tres grupos principales según sus relaciones filogenéticas. Se predijeron las estructuras y motivos conservados para los 22 genes. El análisis de elementos cis-actuantes reveló elementos responsivos al estrés y a fitohormonas en las regiones promotoras de los genes, pero los tipos y números variaron entre los diferentes grupos de genes. Los análisis de perfiles de transcripción revelaron que se expresaron de manera específica en los tejidos, con niveles de transcripción particularmente altos en las raíces. Los perfiles de transcripción bajo estrés abiótico se detectaron mediante qRT-PCR, y los resultados validaron aún más la función crítica de estos genes. Este estudio proporciona información básica sobre la familia RsHsf y allana el camino para futuras investigaciones que aclaren sus roles precisos y para criar nuevas variedades tolerantes al estrés.